林业科学研究
林業科學研究
임업과학연구
FOREST RESEARCH
2013年
6期
744-751
,共8页
林萍%姚小华%曹永庆%龙伟%王开良%滕建华
林萍%姚小華%曹永慶%龍偉%王開良%滕建華
림평%요소화%조영경%룡위%왕개량%등건화
普通油茶%泛素结合酶%Solexa测序%生物信息学
普通油茶%汎素結閤酶%Solexa測序%生物信息學
보통유다%범소결합매%Solexa측서%생물신식학
Camellia oleifera%ubiquitin-conjugating enzyme (E2)%Solexa sequencing%bioinformatics
泛素结合酶(E2)是泛素/26S蛋白酶体途径中3个关键酶之一,在靶蛋白识别、与泛素连接酶(E3)互作等蛋白的泛素依赖性水解和N-末端规则依赖性水解途径的关键环节中起重要作用.采用Solexa测序技术获得了1条普通油茶E2的全长cDNA序列,命名为UBE2-J2,该基因编码239AA,与其它物种的E2具有较高的一致性和相似性;同源建模的结果表明:普通油茶UBE2-J2蛋白具有泛素结合酶催化位点(UBCc),第8～122位氨基酸碱基为其泛素结合酶基因家族的保守区域,第75～122位氨基酸残基区域中有17个可与泛素形成硫酯键中间产物的残基,其中,87位的半胱氨酸残基是该酶活性中心位点,另有5个残基是与E3酶相互作用的位点.UBE2-J2具有C端延伸结构,故普通油茶UBE2-J2蛋白属于Ⅱ类E2基因家族成员.
汎素結閤酶(E2)是汎素/26S蛋白酶體途徑中3箇關鍵酶之一,在靶蛋白識彆、與汎素連接酶(E3)互作等蛋白的汎素依賴性水解和N-末耑規則依賴性水解途徑的關鍵環節中起重要作用.採用Solexa測序技術穫得瞭1條普通油茶E2的全長cDNA序列,命名為UBE2-J2,該基因編碼239AA,與其它物種的E2具有較高的一緻性和相似性;同源建模的結果錶明:普通油茶UBE2-J2蛋白具有汎素結閤酶催化位點(UBCc),第8～122位氨基痠堿基為其汎素結閤酶基因傢族的保守區域,第75～122位氨基痠殘基區域中有17箇可與汎素形成硫酯鍵中間產物的殘基,其中,87位的半胱氨痠殘基是該酶活性中心位點,另有5箇殘基是與E3酶相互作用的位點.UBE2-J2具有C耑延伸結構,故普通油茶UBE2-J2蛋白屬于Ⅱ類E2基因傢族成員.
범소결합매(E2)시범소/26S단백매체도경중3개관건매지일,재파단백식별、여범소련접매(E3)호작등단백적범소의뢰성수해화N-말단규칙의뢰성수해도경적관건배절중기중요작용.채용Solexa측서기술획득료1조보통유다E2적전장cDNA서렬,명명위UBE2-J2,해기인편마239AA,여기타물충적E2구유교고적일치성화상사성;동원건모적결과표명:보통유다UBE2-J2단백구유범소결합매최화위점(UBCc),제8～122위안기산감기위기범소결합매기인가족적보수구역,제75～122위안기산잔기구역중유17개가여범소형성류지건중간산물적잔기,기중,87위적반광안산잔기시해매활성중심위점,령유5개잔기시여E3매상호작용적위점.UBE2-J2구유C단연신결구,고보통유다UBE2-J2단백속우Ⅱ류E2기인가족성원.
