遗传
遺傳
유전
HEREDITAS(BEIJING)
2013年
12期
1403-1414
,共12页
陈昊%蒋桂雄%龙洪旭%谭晓风
陳昊%蔣桂雄%龍洪旭%譚曉風
진호%장계웅%룡홍욱%담효풍
油桐(Verniciafordii)%油脂合成途径%RNA-seq%转录组%差异表达基因
油桐(Verniciafordii)%油脂閤成途徑%RNA-seq%轉錄組%差異錶達基因
유동(Verniciafordii)%유지합성도경%RNA-seq%전록조%차이표체기인
Tung oil tree%oil synthesis pathway%RNA-seq%transcriptome%differentially expressed genes
油桐是我国重要的木本油料植物,过去对油桐的研究主要集中于栽培和常规育种,与油桐种仁油脂合成相关的分子机理研究还未见报道.文章采用RNA-seq技术对油桐种子油脂合成的3个不同时期的转录组进行比较,获得了大量差异表达的Unigene序列.在此基础上,通过GO分类和Pathway富集性分析将这些差异表达Unigene归类于128个代谢途径,其中包含与油脂合成相关的脂肪酸生物合成和甘油磷脂代谢途径.桐酸经脂肪酸生物合成途径合成后通过甘油磷脂代谢途径以桐油的形式贮存.将这两个代谢途径的Unigene序列在KEGG数据库中进行比对,获得了一些关键酶的同源蛋白质.文章通过对编码这些同源蛋白质的基因在油桐种子油脂合成期的表达模式进行分析,以期为油桐油脂合成,尤其是桐酸合成机理的解析提供理论参考,并为油桐的遗传改良提供潜在的基因资源,从而提高油桐的单位面积产量.
油桐是我國重要的木本油料植物,過去對油桐的研究主要集中于栽培和常規育種,與油桐種仁油脂閤成相關的分子機理研究還未見報道.文章採用RNA-seq技術對油桐種子油脂閤成的3箇不同時期的轉錄組進行比較,穫得瞭大量差異錶達的Unigene序列.在此基礎上,通過GO分類和Pathway富集性分析將這些差異錶達Unigene歸類于128箇代謝途徑,其中包含與油脂閤成相關的脂肪痠生物閤成和甘油燐脂代謝途徑.桐痠經脂肪痠生物閤成途徑閤成後通過甘油燐脂代謝途徑以桐油的形式貯存.將這兩箇代謝途徑的Unigene序列在KEGG數據庫中進行比對,穫得瞭一些關鍵酶的同源蛋白質.文章通過對編碼這些同源蛋白質的基因在油桐種子油脂閤成期的錶達模式進行分析,以期為油桐油脂閤成,尤其是桐痠閤成機理的解析提供理論參攷,併為油桐的遺傳改良提供潛在的基因資源,從而提高油桐的單位麵積產量.
유동시아국중요적목본유료식물,과거대유동적연구주요집중우재배화상규육충,여유동충인유지합성상관적분자궤리연구환미견보도.문장채용RNA-seq기술대유동충자유지합성적3개불동시기적전록조진행비교,획득료대량차이표체적Unigene서렬.재차기출상,통과GO분류화Pathway부집성분석장저사차이표체Unigene귀류우128개대사도경,기중포함여유지합성상관적지방산생물합성화감유린지대사도경.동산경지방산생물합성도경합성후통과감유린지대사도경이동유적형식저존.장저량개대사도경적Unigene서렬재KEGG수거고중진행비대,획득료일사관건매적동원단백질.문장통과대편마저사동원단백질적기인재유동충자유지합성기적표체모식진행분석,이기위유동유지합성,우기시동산합성궤리적해석제공이론삼고,병위유동적유전개량제공잠재적기인자원,종이제고유동적단위면적산량.
