华南农业大学学报
華南農業大學學報
화남농업대학학보
JOURNAL OF SOUTH CHINA AGRICULTURAL UNIVERSITY
2013年
1期
76-82
,共7页
崔奎青%刘庆友%李秀林%王志强%石德顺
崔奎青%劉慶友%李秀林%王誌彊%石德順
최규청%류경우%리수림%왕지강%석덕순
水牛%线粒体控制区%多态性
水牛%線粒體控製區%多態性
수우%선립체공제구%다태성
为探讨沼泽型水牛与河流型水牛之间的线粒体D-loop区差异与进化关系,对26头广西本地水牛、8头贵州贵阳水牛、11头广西水牛与河流型水牛杂交后代、9头尼里拉菲和12头摩拉水牛(共5个群体66头水牛个体)的线粒体全长D-loop序列进行了扩增测序分析.结果发现66头水牛912 bp的D-loop多重序列比较有147个多态位点,形成58个单体型,沼泽型水牛与河流型水牛单体型明显分成2簇.以牛为外群构建的单体型进化树显示,沼泽型与河流型水牛分成明显2大支,河流型水牛聚成1支,而沼泽型水牛内部又分成2个侧支.通过Median joining network分析亦发现3个不同的簇,与进化树分析结果一致.对该区碱基错配分布分析表明,水牛群体在历史上发生2次独立的群体扩增事件.为进一步验证试验结果,从GenBank下载了211条水牛D-loop序列与笔者研究获得的序列整合分析,在共有序列878 bp区域中,包含了158个多态位点和129个单体型,以牛为外群的进化树分析与单体型网络分析表明,沼泽型水牛分成2簇,所有的河流型水牛聚集成紧密的1簇.碱基错配分布分析结果呈现2个明显的峰,进一步推断水牛群体在历史上发生过2次较大的群体扩增事件.综合上述研究结果推断,沼泽型水牛与河流型水牛来自不同的家养化事件,沼泽型水牛起源于中国,其祖先可能存在2个基因池.
為探討沼澤型水牛與河流型水牛之間的線粒體D-loop區差異與進化關繫,對26頭廣西本地水牛、8頭貴州貴暘水牛、11頭廣西水牛與河流型水牛雜交後代、9頭尼裏拉菲和12頭摩拉水牛(共5箇群體66頭水牛箇體)的線粒體全長D-loop序列進行瞭擴增測序分析.結果髮現66頭水牛912 bp的D-loop多重序列比較有147箇多態位點,形成58箇單體型,沼澤型水牛與河流型水牛單體型明顯分成2簇.以牛為外群構建的單體型進化樹顯示,沼澤型與河流型水牛分成明顯2大支,河流型水牛聚成1支,而沼澤型水牛內部又分成2箇側支.通過Median joining network分析亦髮現3箇不同的簇,與進化樹分析結果一緻.對該區堿基錯配分佈分析錶明,水牛群體在歷史上髮生2次獨立的群體擴增事件.為進一步驗證試驗結果,從GenBank下載瞭211條水牛D-loop序列與筆者研究穫得的序列整閤分析,在共有序列878 bp區域中,包含瞭158箇多態位點和129箇單體型,以牛為外群的進化樹分析與單體型網絡分析錶明,沼澤型水牛分成2簇,所有的河流型水牛聚集成緊密的1簇.堿基錯配分佈分析結果呈現2箇明顯的峰,進一步推斷水牛群體在歷史上髮生過2次較大的群體擴增事件.綜閤上述研究結果推斷,沼澤型水牛與河流型水牛來自不同的傢養化事件,沼澤型水牛起源于中國,其祖先可能存在2箇基因池.
위탐토소택형수우여하류형수우지간적선립체D-loop구차이여진화관계,대26두엄서본지수우、8두귀주귀양수우、11두엄서수우여하류형수우잡교후대、9두니리랍비화12두마랍수우(공5개군체66두수우개체)적선립체전장D-loop서렬진행료확증측서분석.결과발현66두수우912 bp적D-loop다중서렬비교유147개다태위점,형성58개단체형,소택형수우여하류형수우단체형명현분성2족.이우위외군구건적단체형진화수현시,소택형여하류형수우분성명현2대지,하류형수우취성1지,이소택형수우내부우분성2개측지.통과Median joining network분석역발현3개불동적족,여진화수분석결과일치.대해구감기착배분포분석표명,수우군체재역사상발생2차독립적군체확증사건.위진일보험증시험결과,종GenBank하재료211조수우D-loop서렬여필자연구획득적서렬정합분석,재공유서렬878 bp구역중,포함료158개다태위점화129개단체형,이우위외군적진화수분석여단체형망락분석표명,소택형수우분성2족,소유적하류형수우취집성긴밀적1족.감기착배분포분석결과정현2개명현적봉,진일보추단수우군체재역사상발생과2차교대적군체확증사건.종합상술연구결과추단,소택형수우여하류형수우래자불동적가양화사건,소택형수우기원우중국,기조선가능존재2개기인지.