山西农业科学
山西農業科學
산서농업과학
JOURNAL OF SHANXI AGRICULTURAL SCIENCES
2013年
2期
110-114,145
,共6页
戎宏立%王长彪%李倩%孟玉平%曹秋芬
戎宏立%王長彪%李倩%孟玉平%曹鞦芬
융굉립%왕장표%리천%맹옥평%조추분
枣结果枝%EST分析%核糖体蛋白%生物信息学
棘結果枝%EST分析%覈糖體蛋白%生物信息學
조결과지%EST분석%핵당체단백%생물신식학
应用生物信息学的方法对枣(Ziziphus jujuba Mill.)生长初期结果枝的cDNA文库ESTs进行了功能注释,查找核糖体蛋白基因,并对其氨基酸序列组成、基本理化性质、蛋白质二级结构、疏水性/亲水性及潜在磷酸化位点等进行了初步分析预测,旨在了解其结构特征,进而发掘枣树的优良基因.结果表明,625个ESTs中,有397个ESTs与NCBI中已知功能基因相似性较高(其中重复ESTs 77个)；将320条ESTs通过KEGG数据库进行代谢分析,得到123条ESTs的62个代谢途径.对获得的枣树24个核糖体蛋白进行分析发现,其分子量在6 931.12～32 764.44之间,α-螺旋和无规则卷曲是其主要的结构元件,多肽链都表现为亲水性,磷酸化潜在位点普遍存在于核糖体蛋白多肽链中；并构建了24个核糖体蛋白的进化树,对其分子进化进行了探讨.
應用生物信息學的方法對棘(Ziziphus jujuba Mill.)生長初期結果枝的cDNA文庫ESTs進行瞭功能註釋,查找覈糖體蛋白基因,併對其氨基痠序列組成、基本理化性質、蛋白質二級結構、疏水性/親水性及潛在燐痠化位點等進行瞭初步分析預測,旨在瞭解其結構特徵,進而髮掘棘樹的優良基因.結果錶明,625箇ESTs中,有397箇ESTs與NCBI中已知功能基因相似性較高(其中重複ESTs 77箇)；將320條ESTs通過KEGG數據庫進行代謝分析,得到123條ESTs的62箇代謝途徑.對穫得的棘樹24箇覈糖體蛋白進行分析髮現,其分子量在6 931.12～32 764.44之間,α-螺鏇和無規則捲麯是其主要的結構元件,多肽鏈都錶現為親水性,燐痠化潛在位點普遍存在于覈糖體蛋白多肽鏈中；併構建瞭24箇覈糖體蛋白的進化樹,對其分子進化進行瞭探討.
응용생물신식학적방법대조(Ziziphus jujuba Mill.)생장초기결과지적cDNA문고ESTs진행료공능주석,사조핵당체단백기인,병대기안기산서렬조성、기본이화성질、단백질이급결구、소수성/친수성급잠재린산화위점등진행료초보분석예측,지재료해기결구특정,진이발굴조수적우량기인.결과표명,625개ESTs중,유397개ESTs여NCBI중이지공능기인상사성교고(기중중복ESTs 77개)；장320조ESTs통과KEGG수거고진행대사분석,득도123조ESTs적62개대사도경.대획득적조수24개핵당체단백진행분석발현,기분자량재6 931.12～32 764.44지간,α-라선화무규칙권곡시기주요적결구원건,다태련도표현위친수성,린산화잠재위점보편존재우핵당체단백다태련중；병구건료24개핵당체단백적진화수,대기분자진화진행료탐토.
