大连海洋大学学报
大連海洋大學學報
대련해양대학학보
JOURNAL OF DALIAN FISHERIES UNIVERSITY
2013年
6期
535-541
,共7页
田燚%张丙龙%常亚青%董萍萍%陈百尧%伏光辉%安建
田燚%張丙龍%常亞青%董萍萍%陳百堯%伏光輝%安建
전일%장병룡%상아청%동평평%진백요%복광휘%안건
刺参%Y-box基因克隆%序列分析%基因表达
刺參%Y-box基因剋隆%序列分析%基因錶達
자삼%Y-box기인극륭%서렬분석%기인표체
Apostichopus japonicus%Y-box gene cloning%sequence analysis%gene expression
为了探究Y-box基因在刺参Apostichopus japonicus胚胎发育及性别分化中的作用,根据已有的EST序列,通过RACE技术克隆了刺参Y-box基因的cDNA全长序列,并利用实时定量PCR技术进行了表达模式分析.结果表明:刺参Y-box基因cDNA全长为1 142 bp,5'端UTR为102 bp,3'端UTR为215 bp,开放阅读框(ORF)为825 bp; Y-box基因cDNA全长编码274个氨基酸的前体蛋白,预测蛋白的相对分子质量为31 100,理论等电点为9.46,是亲水性蛋白;刺参Y-box氨基酸序列包含氨基酸N末端结构域、C末端结构域和冷休克结构域(CSD),其中CSD区在Y-box结合蛋白家族中非常保守;刺参Y-box结合蛋白质的二级结构没有α-螺旋和β-折叠,无规则卷曲占87.23%,延伸链占12.77%;刺参与其他物种的y-box氨基酸的相似度为27% ~41%,在冷休克区相似度很高,达到75%以上;构建的系统进化树表明,刺参与加州海兔Aplysia californica、栉孔扇贝Chlamys farreri、玻璃海鞘Ciona intestinalis聚为一支,为海洋无脊椎动物;经实时定量PCR检测,Y-box基因在小耳幼体中表达水平最高,且显著高于其他各发育阶段(P<0.05),在雄性性腺中的表达量显著高于雌性性腺(P<0.05).研究表明,Y-box基因在刺参的胚胎发育及性别分化中发挥重要作用.
為瞭探究Y-box基因在刺參Apostichopus japonicus胚胎髮育及性彆分化中的作用,根據已有的EST序列,通過RACE技術剋隆瞭刺參Y-box基因的cDNA全長序列,併利用實時定量PCR技術進行瞭錶達模式分析.結果錶明:刺參Y-box基因cDNA全長為1 142 bp,5'耑UTR為102 bp,3'耑UTR為215 bp,開放閱讀框(ORF)為825 bp; Y-box基因cDNA全長編碼274箇氨基痠的前體蛋白,預測蛋白的相對分子質量為31 100,理論等電點為9.46,是親水性蛋白;刺參Y-box氨基痠序列包含氨基痠N末耑結構域、C末耑結構域和冷休剋結構域(CSD),其中CSD區在Y-box結閤蛋白傢族中非常保守;刺參Y-box結閤蛋白質的二級結構沒有α-螺鏇和β-摺疊,無規則捲麯佔87.23%,延伸鏈佔12.77%;刺參與其他物種的y-box氨基痠的相似度為27% ~41%,在冷休剋區相似度很高,達到75%以上;構建的繫統進化樹錶明,刺參與加州海兔Aplysia californica、櫛孔扇貝Chlamys farreri、玻璃海鞘Ciona intestinalis聚為一支,為海洋無脊椎動物;經實時定量PCR檢測,Y-box基因在小耳幼體中錶達水平最高,且顯著高于其他各髮育階段(P<0.05),在雄性性腺中的錶達量顯著高于雌性性腺(P<0.05).研究錶明,Y-box基因在刺參的胚胎髮育及性彆分化中髮揮重要作用.
위료탐구Y-box기인재자삼Apostichopus japonicus배태발육급성별분화중적작용,근거이유적EST서렬,통과RACE기술극륭료자삼Y-box기인적cDNA전장서렬,병이용실시정량PCR기술진행료표체모식분석.결과표명:자삼Y-box기인cDNA전장위1 142 bp,5'단UTR위102 bp,3'단UTR위215 bp,개방열독광(ORF)위825 bp; Y-box기인cDNA전장편마274개안기산적전체단백,예측단백적상대분자질량위31 100,이론등전점위9.46,시친수성단백;자삼Y-box안기산서렬포함안기산N말단결구역、C말단결구역화랭휴극결구역(CSD),기중CSD구재Y-box결합단백가족중비상보수;자삼Y-box결합단백질적이급결구몰유α-라선화β-절첩,무규칙권곡점87.23%,연신련점12.77%;자삼여기타물충적y-box안기산적상사도위27% ~41%,재랭휴극구상사도흔고,체도75%이상;구건적계통진화수표명,자삼여가주해토Aplysia californica、즐공선패Chlamys farreri、파리해초Ciona intestinalis취위일지,위해양무척추동물;경실시정량PCR검측,Y-box기인재소이유체중표체수평최고,차현저고우기타각발육계단(P<0.05),재웅성성선중적표체량현저고우자성성선(P<0.05).연구표명,Y-box기인재자삼적배태발육급성별분화중발휘중요작용.