烟草科技
煙草科技
연초과기
TOBACCO SCIENCE & TECHNOLOGY
2014年
1期
80-84
,共5页
金大伟%罗朝鹏%杨军%侯明生%王燃%李锋%魏春阳%武明珠%魏攀
金大偉%囉朝鵬%楊軍%侯明生%王燃%李鋒%魏春暘%武明珠%魏攀
금대위%라조붕%양군%후명생%왕연%리봉%위춘양%무명주%위반
黄瓜花叶病毒%基因组%同源性%系统进化树
黃瓜花葉病毒%基因組%同源性%繫統進化樹
황과화협병독%기인조%동원성%계통진화수
Cucumber mosaic virus%Genome%Similarity%Phylogenetic tree
为明确我国湖北烟区烟草黄瓜花叶病毒(Cucumber mosaic virus,CMV)的亚组类型,对湖北地区侵染烟草的CMV HB24株系进行基因组全长克隆和序列分析 结果表明,HB24株系RNA1(GenBank序列号:KC019299)全长为3363个核苷酸(nt),编码993个氨基酸的1a蛋白;RNA2(GenBank序列号:KC019300)全长为3049nt,编码859个氨基酸的2a蛋白和111个氨基酸的2b蛋白;RNA3(GenBank序列号:KC019301)全长为2216nt,编码279个氨基酸的3a蛋白和218个氨基酸的CP蛋白 核苷酸序列同源性分析表明,HB24与Fnv,SD和Q株系RNA1同源性分别为91.6％,91.1％和75.9％,RNA2同源性分别为91.8％,97.8％和69.5％,RNA3同源性分别为92.1％,93.4％和73.2％;与同属花生矮化病毒(Peanut stunt virus,PSV)ER株系RNA1,RNA2和RNA3的同源性分别为65.5％,56.7％和54.1％,与同属番茄不孕病毒(Tomato aspermy virus,TAV)V株系同源性分别为66.9％,57.7％和51.5％ HB24 RNA3 5'NTR(Nontranslated region)的结构分析以及RNA35'NTR和CP基因核苷酸序列系统进化树的分析表明,HB24属于CMV亚组IB.
為明確我國湖北煙區煙草黃瓜花葉病毒(Cucumber mosaic virus,CMV)的亞組類型,對湖北地區侵染煙草的CMV HB24株繫進行基因組全長剋隆和序列分析 結果錶明,HB24株繫RNA1(GenBank序列號:KC019299)全長為3363箇覈苷痠(nt),編碼993箇氨基痠的1a蛋白;RNA2(GenBank序列號:KC019300)全長為3049nt,編碼859箇氨基痠的2a蛋白和111箇氨基痠的2b蛋白;RNA3(GenBank序列號:KC019301)全長為2216nt,編碼279箇氨基痠的3a蛋白和218箇氨基痠的CP蛋白 覈苷痠序列同源性分析錶明,HB24與Fnv,SD和Q株繫RNA1同源性分彆為91.6％,91.1％和75.9％,RNA2同源性分彆為91.8％,97.8％和69.5％,RNA3同源性分彆為92.1％,93.4％和73.2％;與同屬花生矮化病毒(Peanut stunt virus,PSV)ER株繫RNA1,RNA2和RNA3的同源性分彆為65.5％,56.7％和54.1％,與同屬番茄不孕病毒(Tomato aspermy virus,TAV)V株繫同源性分彆為66.9％,57.7％和51.5％ HB24 RNA3 5'NTR(Nontranslated region)的結構分析以及RNA35'NTR和CP基因覈苷痠序列繫統進化樹的分析錶明,HB24屬于CMV亞組IB.
위명학아국호북연구연초황과화협병독(Cucumber mosaic virus,CMV)적아조류형,대호북지구침염연초적CMV HB24주계진행기인조전장극륭화서렬분석 결과표명,HB24주계RNA1(GenBank서렬호:KC019299)전장위3363개핵감산(nt),편마993개안기산적1a단백;RNA2(GenBank서렬호:KC019300)전장위3049nt,편마859개안기산적2a단백화111개안기산적2b단백;RNA3(GenBank서렬호:KC019301)전장위2216nt,편마279개안기산적3a단백화218개안기산적CP단백 핵감산서렬동원성분석표명,HB24여Fnv,SD화Q주계RNA1동원성분별위91.6％,91.1％화75.9％,RNA2동원성분별위91.8％,97.8％화69.5％,RNA3동원성분별위92.1％,93.4％화73.2％;여동속화생왜화병독(Peanut stunt virus,PSV)ER주계RNA1,RNA2화RNA3적동원성분별위65.5％,56.7％화54.1％,여동속번가불잉병독(Tomato aspermy virus,TAV)V주계동원성분별위66.9％,57.7％화51.5％ HB24 RNA3 5'NTR(Nontranslated region)적결구분석이급RNA35'NTR화CP기인핵감산서렬계통진화수적분석표명,HB24속우CMV아조IB.
