西南农业学报
西南農業學報
서남농업학보
SOUTHWEST CHINA JOURNAL OF AGRICULTURAL SCIENCES
2013年
1期
371-376
,共6页
彭金霞%蒋小珍%房振峰%殷勤%韦嫔媛%陈晓汉
彭金霞%蔣小珍%房振峰%慇勤%韋嬪媛%陳曉漢
팽금하%장소진%방진봉%은근%위빈원%진효한
凡纳滨对虾%COPE基因%基因表达%低温%荧光定量PCR
凡納濱對蝦%COPE基因%基因錶達%低溫%熒光定量PCR
범납빈대하%COPE기인%기인표체%저온%형광정량PCR
通过对已知耐寒候选基因-COPE基因的克隆和研究,为凡纳滨对虾耐寒性状的分子机理研究提供依据.运用同源克隆和RACE-PCR技术获得凡纳滨对虾COPE基因(LvCOPE)全长cDNA序列,对其进行了生物信息学分析,采用荧光定量PCR研究了LvCOPE基因的组织表达谱及其在低温胁迫下表达量的变化.结果显示,LvCOPEcDNA全长1217 bp,包含888 bp开放阅读框,编码296个氨基酸残基,具有保守的TPR结构域.各物种COPE蛋白序列构建的系统进化树能准确反映各物种间的进化关系.IvCOPE mRNA在各组织中呈遍在表达,在肌肉组织中表达量最高.低温表达谱分析显示,bCOPE mRNA在低温处理对虾的肝胰腺、心、鳃、肌肉等组织中均呈下调表达,随着处理温度由15℃降至11℃度,其在肝胰腺中表达量逐渐降到最低.因此,LvCOPE在结构和进化上保守,在低温胁迫时呈下调表达,可能在寒冷耐受过程中发挥负调控功能.
通過對已知耐寒候選基因-COPE基因的剋隆和研究,為凡納濱對蝦耐寒性狀的分子機理研究提供依據.運用同源剋隆和RACE-PCR技術穫得凡納濱對蝦COPE基因(LvCOPE)全長cDNA序列,對其進行瞭生物信息學分析,採用熒光定量PCR研究瞭LvCOPE基因的組織錶達譜及其在低溫脅迫下錶達量的變化.結果顯示,LvCOPEcDNA全長1217 bp,包含888 bp開放閱讀框,編碼296箇氨基痠殘基,具有保守的TPR結構域.各物種COPE蛋白序列構建的繫統進化樹能準確反映各物種間的進化關繫.IvCOPE mRNA在各組織中呈遍在錶達,在肌肉組織中錶達量最高.低溫錶達譜分析顯示,bCOPE mRNA在低溫處理對蝦的肝胰腺、心、鰓、肌肉等組織中均呈下調錶達,隨著處理溫度由15℃降至11℃度,其在肝胰腺中錶達量逐漸降到最低.因此,LvCOPE在結構和進化上保守,在低溫脅迫時呈下調錶達,可能在寒冷耐受過程中髮揮負調控功能.
통과대이지내한후선기인-COPE기인적극륭화연구,위범납빈대하내한성상적분자궤리연구제공의거.운용동원극륭화RACE-PCR기술획득범납빈대하COPE기인(LvCOPE)전장cDNA서렬,대기진행료생물신식학분석,채용형광정량PCR연구료LvCOPE기인적조직표체보급기재저온협박하표체량적변화.결과현시,LvCOPEcDNA전장1217 bp,포함888 bp개방열독광,편마296개안기산잔기,구유보수적TPR결구역.각물충COPE단백서렬구건적계통진화수능준학반영각물충간적진화관계.IvCOPE mRNA재각조직중정편재표체,재기육조직중표체량최고.저온표체보분석현시,bCOPE mRNA재저온처리대하적간이선、심、새、기육등조직중균정하조표체,수착처리온도유15℃강지11℃도,기재간이선중표체량축점강도최저.인차,LvCOPE재결구화진화상보수,재저온협박시정하조표체,가능재한랭내수과정중발휘부조공공능.
