西南农业学报
西南農業學報
서남농업학보
SOUTHWEST CHINA JOURNAL OF AGRICULTURAL SCIENCES
2013年
1期
271-277
,共7页
胡延章%杨俊年%王兆丹%陈再刚
鬍延章%楊俊年%王兆丹%陳再剛
호연장%양준년%왕조단%진재강
番茄%番茄脂肪氧化酶D基因%生物信息学%蛋白质结构%载体构建
番茄%番茄脂肪氧化酶D基因%生物信息學%蛋白質結構%載體構建
번가%번가지방양화매D기인%생물신식학%단백질결구%재체구건
利用RT-PCR方法从番茄中克隆了TomloxD的cDNA.采用生物信息学,ChloroP,SMART方法对TomloxD分析与研究,结果表明,TomloxD基因编码是一个由908个氨基酸残基组成的蛋白,蛋白分子量为102.31 kD.在蛋白的N-端有77个氨基酸组成的叶绿体信号肽.TomloxD是一种植物脂肪氧化酶,具有两个保守结构域:在靠近N-端区域有PLAT/LH2结构域,在C-端有pfam:lipoxygenase结构域.TomloxD蛋白与大豆LOX3蛋白三维结构高度重叠.TomloxD与来自马铃薯、烟草、油橄榄、拟南芥和玉米的脂肪氧化酶的一致性分别为96%、90%、82%、72%和67%.系统进化关系分析表明TomloxD与来源于双子叶植物的脂肪氧化酶蛋白的亲缘关系更近,而与单子叶植物的相对较远.构建植物高效表达载体TomloxD-pBIN19,并导入根癌农杆菌LBA4404中,得到植物转化工程菌,这为下一步用于番茄等作物的转基因操作,进一步研究TomloxD基因的功能,获得高抗逆性的转基因作物奠定了基础.
利用RT-PCR方法從番茄中剋隆瞭TomloxD的cDNA.採用生物信息學,ChloroP,SMART方法對TomloxD分析與研究,結果錶明,TomloxD基因編碼是一箇由908箇氨基痠殘基組成的蛋白,蛋白分子量為102.31 kD.在蛋白的N-耑有77箇氨基痠組成的葉綠體信號肽.TomloxD是一種植物脂肪氧化酶,具有兩箇保守結構域:在靠近N-耑區域有PLAT/LH2結構域,在C-耑有pfam:lipoxygenase結構域.TomloxD蛋白與大豆LOX3蛋白三維結構高度重疊.TomloxD與來自馬鈴藷、煙草、油橄欖、擬南芥和玉米的脂肪氧化酶的一緻性分彆為96%、90%、82%、72%和67%.繫統進化關繫分析錶明TomloxD與來源于雙子葉植物的脂肪氧化酶蛋白的親緣關繫更近,而與單子葉植物的相對較遠.構建植物高效錶達載體TomloxD-pBIN19,併導入根癌農桿菌LBA4404中,得到植物轉化工程菌,這為下一步用于番茄等作物的轉基因操作,進一步研究TomloxD基因的功能,穫得高抗逆性的轉基因作物奠定瞭基礎.
이용RT-PCR방법종번가중극륭료TomloxD적cDNA.채용생물신식학,ChloroP,SMART방법대TomloxD분석여연구,결과표명,TomloxD기인편마시일개유908개안기산잔기조성적단백,단백분자량위102.31 kD.재단백적N-단유77개안기산조성적협록체신호태.TomloxD시일충식물지방양화매,구유량개보수결구역:재고근N-단구역유PLAT/LH2결구역,재C-단유pfam:lipoxygenase결구역.TomloxD단백여대두LOX3단백삼유결구고도중첩.TomloxD여래자마령서、연초、유감람、의남개화옥미적지방양화매적일치성분별위96%、90%、82%、72%화67%.계통진화관계분석표명TomloxD여래원우쌍자협식물적지방양화매단백적친연관계경근,이여단자협식물적상대교원.구건식물고효표체재체TomloxD-pBIN19,병도입근암농간균LBA4404중,득도식물전화공정균,저위하일보용우번가등작물적전기인조작,진일보연구TomloxD기인적공능,획득고항역성적전기인작물전정료기출.