西南农业学报
西南農業學報
서남농업학보
SOUTHWEST CHINA JOURNAL OF AGRICULTURAL SCIENCES
2013年
6期
2221-2226
,共6页
茶树%CsSMT基因%生物信息学
茶樹%CsSMT基因%生物信息學
다수%CsSMT기인%생물신식학
Tea plant%CsSMT gene%Boinformatics
为揭示茶树(Camellia sinensis)硒代半胱氨酸甲基转移酶(Selenocysteine methyltransferase,SMT)基因CsSMT的生物学功能及其分子调控机理,利用生物基因组学数据库和生物信息学分析软件,对CsSMT进行生物信息学分析,预测该基因编码产物的理化性质、结构与功能,同时构建CsSMT同源基因的系统进化树.结果表明:CsSMT基因cDNA全长1368 bp,开放阅读框位于50～l105 bp处.编码产物为稳定的亲水性蛋白,分子式为C11670 H2645 N459 O532 S15,无跨膜结构,无信号肽,定位于细胞质基质.二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主,三维建模成功.系统进化分析表明,CsSMT基因mRNA与拟南芥同型半胱氨酸S-甲基转移酶基因(Homocysteine S-methyltransferase,HMT)聚为一组.
為揭示茶樹(Camellia sinensis)硒代半胱氨痠甲基轉移酶(Selenocysteine methyltransferase,SMT)基因CsSMT的生物學功能及其分子調控機理,利用生物基因組學數據庫和生物信息學分析軟件,對CsSMT進行生物信息學分析,預測該基因編碼產物的理化性質、結構與功能,同時構建CsSMT同源基因的繫統進化樹.結果錶明:CsSMT基因cDNA全長1368 bp,開放閱讀框位于50～l105 bp處.編碼產物為穩定的親水性蛋白,分子式為C11670 H2645 N459 O532 S15,無跨膜結構,無信號肽,定位于細胞質基質.二級結構以α-螺鏇和無規則捲麯為主,三維建模成功.繫統進化分析錶明,CsSMT基因mRNA與擬南芥同型半胱氨痠S-甲基轉移酶基因(Homocysteine S-methyltransferase,HMT)聚為一組.
위게시다수(Camellia sinensis)서대반광안산갑기전이매(Selenocysteine methyltransferase,SMT)기인CsSMT적생물학공능급기분자조공궤리,이용생물기인조학수거고화생물신식학분석연건,대CsSMT진행생물신식학분석,예측해기인편마산물적이화성질、결구여공능,동시구건CsSMT동원기인적계통진화수.결과표명:CsSMT기인cDNA전장1368 bp,개방열독광위우50～l105 bp처.편마산물위은정적친수성단백,분자식위C11670 H2645 N459 O532 S15,무과막결구,무신호태,정위우세포질기질.이급결구이α-라선화무규칙권곡위주,삼유건모성공.계통진화분석표명,CsSMT기인mRNA여의남개동형반광안산S-갑기전이매기인(Homocysteine S-methyltransferase,HMT)취위일조.
