西南农业学报
西南農業學報
서남농업학보
SOUTHWEST CHINA JOURNAL OF AGRICULTURAL SCIENCES
2013年
6期
2214-2220
,共7页
陆小静%张振文%罗秀芹%安飞飞%李开绵%陈松笔
陸小靜%張振文%囉秀芹%安飛飛%李開綿%陳鬆筆
륙소정%장진문%라수근%안비비%리개면%진송필
木薯%生物信息学%耐旱基因%CAT
木藷%生物信息學%耐旱基因%CAT
목서%생물신식학%내한기인%CAT
Cassava%Bioinformatics%Drought tolerance genes%CAT
利用在线提供的生物信息学软件及Pathway Studio软件,以木薯(Manihot esculenta)过氧化氢酶(CAT)为研究对象,与蓖麻、麻风树、橡胶树、常绿大戟、杨树、盐地碱蓬、樟子松、水稻、甘薯、马铃薯10种植物CAT的氨基酸序列进行比较分析,揭示CAT氨基酸结构与耐旱特性的相关性.结果显示,木薯CAT1全长为1782bp,包含一条长1479 bp的开放读码框,编码492个氨基酸,通过同源性比对发现木薯CAT氨基酸序列与蓖麻、麻风树、橡胶树、常绿大戟、杨树、盐地碱蓬、樟子松、水稻、甘薯、马铃薯的同源性分别为82%、92%、81%、84%、80%、80%、79%、78%、78%、80%.木薯与麻风树同源性达到最高,为92%,最低是水稻和甘薯,为78%.木薯及其它10种植物CAT氨基酸序列的共同点为:没有导肽,不存在信号肽,为亲水性蛋白,无规则卷曲是最大量的结构元件,β-转角是最小的结构元件.此外,对跨膜结构域进行预测,木薯及其它10种植物均不存在跨膜结构域,但木薯CAT1整条肽链都位于膜内,其它10种植物的CAT均在膜外.CAT通过生物调节互作网络,在水杨酸(SA)、SOS及脱落酸(ABA)等的多重作用下,调节植物过氧化氢(H2O2)含量,提高植物抵抗逆境的能力.
利用在線提供的生物信息學軟件及Pathway Studio軟件,以木藷(Manihot esculenta)過氧化氫酶(CAT)為研究對象,與蓖痳、痳風樹、橡膠樹、常綠大戟、楊樹、鹽地堿蓬、樟子鬆、水稻、甘藷、馬鈴藷10種植物CAT的氨基痠序列進行比較分析,揭示CAT氨基痠結構與耐旱特性的相關性.結果顯示,木藷CAT1全長為1782bp,包含一條長1479 bp的開放讀碼框,編碼492箇氨基痠,通過同源性比對髮現木藷CAT氨基痠序列與蓖痳、痳風樹、橡膠樹、常綠大戟、楊樹、鹽地堿蓬、樟子鬆、水稻、甘藷、馬鈴藷的同源性分彆為82%、92%、81%、84%、80%、80%、79%、78%、78%、80%.木藷與痳風樹同源性達到最高,為92%,最低是水稻和甘藷,為78%.木藷及其它10種植物CAT氨基痠序列的共同點為:沒有導肽,不存在信號肽,為親水性蛋白,無規則捲麯是最大量的結構元件,β-轉角是最小的結構元件.此外,對跨膜結構域進行預測,木藷及其它10種植物均不存在跨膜結構域,但木藷CAT1整條肽鏈都位于膜內,其它10種植物的CAT均在膜外.CAT通過生物調節互作網絡,在水楊痠(SA)、SOS及脫落痠(ABA)等的多重作用下,調節植物過氧化氫(H2O2)含量,提高植物牴抗逆境的能力.
이용재선제공적생물신식학연건급Pathway Studio연건,이목서(Manihot esculenta)과양화경매(CAT)위연구대상,여비마、마풍수、상효수、상록대극、양수、염지감봉、장자송、수도、감서、마령서10충식물CAT적안기산서렬진행비교분석,게시CAT안기산결구여내한특성적상관성.결과현시,목서CAT1전장위1782bp,포함일조장1479 bp적개방독마광,편마492개안기산,통과동원성비대발현목서CAT안기산서렬여비마、마풍수、상효수、상록대극、양수、염지감봉、장자송、수도、감서、마령서적동원성분별위82%、92%、81%、84%、80%、80%、79%、78%、78%、80%.목서여마풍수동원성체도최고,위92%,최저시수도화감서,위78%.목서급기타10충식물CAT안기산서렬적공동점위:몰유도태,불존재신호태,위친수성단백,무규칙권곡시최대량적결구원건,β-전각시최소적결구원건.차외,대과막결구역진행예측,목서급기타10충식물균불존재과막결구역,단목서CAT1정조태련도위우막내,기타10충식물적CAT균재막외.CAT통과생물조절호작망락,재수양산(SA)、SOS급탈락산(ABA)등적다중작용하,조절식물과양화경(H2O2)함량,제고식물저항역경적능력.