西南农业学报
西南農業學報
서남농업학보
SOUTHWEST CHINA JOURNAL OF AGRICULTURAL SCIENCES
2013年
6期
2441-2446
,共6页
任鹏鸿%韩睿%马胜超%李莉
任鵬鴻%韓睿%馬勝超%李莉
임붕홍%한예%마성초%리리
菊芋%SSR-PCR%优化%引物筛选%分子鉴别
菊芋%SSR-PCR%優化%引物篩選%分子鑒彆
국우%SSR-PCR%우화%인물사선%분자감별
Jerusalem artichoke%SSR-PCR%Optimization%Primer screening%Molecular identification
本研究通过单因子优化试验和L16 (45)正交试验设计的方法,对菊芋SSR-PCR反应体系进行优化.结果表明,20ul最佳反应体系:10×PCR扩增缓冲液,2.5 mmol/L Mg2+,0.20 mmol/L dNTPs,0.30 μmol/L正反引物,0.2 U Taq DNA聚合酶和50 ng模板DNA.利用该优化体系,从100个SSR引物组合中筛选出12个清晰且多态性高的引物组合对3个品种的菊芋DNA序列进行扩增,得到58个位点,其中多态性位点39个,多态率为67.2％;建立3个菊芋品种分子识别卡,用2对引物组合的6个多态性位点即可将其分开.本研究为后续应用SSR分子标记技术对菊芋进行种质资源分子遗传学方面的研究提供依据.
本研究通過單因子優化試驗和L16 (45)正交試驗設計的方法,對菊芋SSR-PCR反應體繫進行優化.結果錶明,20ul最佳反應體繫:10×PCR擴增緩遲液,2.5 mmol/L Mg2+,0.20 mmol/L dNTPs,0.30 μmol/L正反引物,0.2 U Taq DNA聚閤酶和50 ng模闆DNA.利用該優化體繫,從100箇SSR引物組閤中篩選齣12箇清晰且多態性高的引物組閤對3箇品種的菊芋DNA序列進行擴增,得到58箇位點,其中多態性位點39箇,多態率為67.2％;建立3箇菊芋品種分子識彆卡,用2對引物組閤的6箇多態性位點即可將其分開.本研究為後續應用SSR分子標記技術對菊芋進行種質資源分子遺傳學方麵的研究提供依據.
본연구통과단인자우화시험화L16 (45)정교시험설계적방법,대국우SSR-PCR반응체계진행우화.결과표명,20ul최가반응체계:10×PCR확증완충액,2.5 mmol/L Mg2+,0.20 mmol/L dNTPs,0.30 μmol/L정반인물,0.2 U Taq DNA취합매화50 ng모판DNA.이용해우화체계,종100개SSR인물조합중사선출12개청석차다태성고적인물조합대3개품충적국우DNA서렬진행확증,득도58개위점,기중다태성위점39개,다태솔위67.2％;건립3개국우품충분자식별잡,용2대인물조합적6개다태성위점즉가장기분개.본연구위후속응용SSR분자표기기술대국우진행충질자원분자유전학방면적연구제공의거.
