热带作物学报
熱帶作物學報
열대작물학보
CHINESE JOURNAL OF TROPICAL CROPS
2014年
1期
74-81
,共8页
练从龙%赖钟雄%卢秉国%林玉玲%冯新
練從龍%賴鐘雄%盧秉國%林玉玲%馮新
련종룡%뢰종웅%로병국%림옥령%풍신
荔枝古树%胚性愈伤组织%Fe-SOD%克隆%可变剪接%生物信息学分析
荔枝古樹%胚性愈傷組織%Fe-SOD%剋隆%可變剪接%生物信息學分析
려지고수%배성유상조직%Fe-SOD%극륭%가변전접%생물신식학분석
An ancient litchi tree%Embryogenic callus%Fe-SOD%Cloning%Alternative splicing%Bioinformatics
为了解Fe-SOD在荔枝古树胚性愈伤组织保存中的分子机制.选择荔枝古树“宋荔”花药诱导而来的胚性愈伤组织为试验材料,采用同源克隆和RACE方法,获得荔枝Fe-SOD的两个转录本和基因组序列,并对该基因组的内含子进行分析.克隆获得长1 285 bp含有完整开放阅读框的荔枝Fe-SOD核酸序列,其编码1个含有250个氨基酸的蛋白质,将该序列命名为LcFe-SOD7a.生物信息学分析结果表明:该蛋白为稳定的、亲水的、含跨膜结构域的偏酸性蛋白质,定位于微体(过氧化物酶体)和细胞质,具有多样的磷酸化位点.LcFe-SOD7a基因组序列长2 284 bp,含7个内含子,其中第4个内含子较长,达920 bp.同时还得到其中的1条内含子驻留型可变剪接基因.该可变剪接基因提前终止,仅编码207个氨基酸的蛋白质,将该可变剪接基因命名为Lc Fe-SOD7b.
為瞭解Fe-SOD在荔枝古樹胚性愈傷組織保存中的分子機製.選擇荔枝古樹“宋荔”花藥誘導而來的胚性愈傷組織為試驗材料,採用同源剋隆和RACE方法,穫得荔枝Fe-SOD的兩箇轉錄本和基因組序列,併對該基因組的內含子進行分析.剋隆穫得長1 285 bp含有完整開放閱讀框的荔枝Fe-SOD覈痠序列,其編碼1箇含有250箇氨基痠的蛋白質,將該序列命名為LcFe-SOD7a.生物信息學分析結果錶明:該蛋白為穩定的、親水的、含跨膜結構域的偏痠性蛋白質,定位于微體(過氧化物酶體)和細胞質,具有多樣的燐痠化位點.LcFe-SOD7a基因組序列長2 284 bp,含7箇內含子,其中第4箇內含子較長,達920 bp.同時還得到其中的1條內含子駐留型可變剪接基因.該可變剪接基因提前終止,僅編碼207箇氨基痠的蛋白質,將該可變剪接基因命名為Lc Fe-SOD7b.
위료해Fe-SOD재려지고수배성유상조직보존중적분자궤제.선택려지고수“송려”화약유도이래적배성유상조직위시험재료,채용동원극륭화RACE방법,획득려지Fe-SOD적량개전록본화기인조서렬,병대해기인조적내함자진행분석.극륭획득장1 285 bp함유완정개방열독광적려지Fe-SOD핵산서렬,기편마1개함유250개안기산적단백질,장해서렬명명위LcFe-SOD7a.생물신식학분석결과표명:해단백위은정적、친수적、함과막결구역적편산성단백질,정위우미체(과양화물매체)화세포질,구유다양적린산화위점.LcFe-SOD7a기인조서렬장2 284 bp,함7개내함자,기중제4개내함자교장,체920 bp.동시환득도기중적1조내함자주류형가변전접기인.해가변전접기인제전종지,부편마207개안기산적단백질,장해가변전접기인명명위Lc Fe-SOD7b.
