热带作物学报
熱帶作物學報
열대작물학보
CHINESE JOURNAL OF TROPICAL CROPS
2014年
1期
12-16
,共5页
胡文舜%蒋际谋%黄爱萍%许奇志%陈秀萍%郑少泉
鬍文舜%蔣際謀%黃愛萍%許奇誌%陳秀萍%鄭少泉
호문순%장제모%황애평%허기지%진수평%정소천
枇杷属%trnH-psbA%DNA条形码%序列分析%系统进化
枇杷屬%trnH-psbA%DNA條形碼%序列分析%繫統進化
비파속%trnH-psbA%DNA조형마%서렬분석%계통진화
Eriobotrya%TtrnH-psbA%DNA barcode%Sequence analysis%Phylogeny evolution
选用枇杷野生近缘种‘栎叶枇杷’和栽培种‘早钟6号’、‘香妃’,对其叶绿体基因组trnH-psbA基因间隔区进行PCR克隆与测序,利用生物信息学方法分析其序列特征,并构建苹果亚科内19个属的系统发育树.结果表明:trnH-psbA序列长323～392 bp(GenBank登录号:KF022254、KF022255、KF022256),G+C含量30.10％～33.13％,共有1个核苷酸替换(substitution)和2个插入/缺失(indel);基于tmH-psbA DNA条形码序列的分子系统进化分析结果表明,苹果亚科内形成2个大的分支,枇杷属与石斑木属的亲缘关系最近(平均遗传距离为0.055).此结果表明叶绿体基因trnH-psbA序列可有效地进行枇杷属内物种鉴别及属间分类,是枇杷属植物DNA条形码研究的标准基因之一.
選用枇杷野生近緣種‘櫟葉枇杷’和栽培種‘早鐘6號’、‘香妃’,對其葉綠體基因組trnH-psbA基因間隔區進行PCR剋隆與測序,利用生物信息學方法分析其序列特徵,併構建蘋果亞科內19箇屬的繫統髮育樹.結果錶明:trnH-psbA序列長323～392 bp(GenBank登錄號:KF022254、KF022255、KF022256),G+C含量30.10％～33.13％,共有1箇覈苷痠替換(substitution)和2箇插入/缺失(indel);基于tmH-psbA DNA條形碼序列的分子繫統進化分析結果錶明,蘋果亞科內形成2箇大的分支,枇杷屬與石斑木屬的親緣關繫最近(平均遺傳距離為0.055).此結果錶明葉綠體基因trnH-psbA序列可有效地進行枇杷屬內物種鑒彆及屬間分類,是枇杷屬植物DNA條形碼研究的標準基因之一.
선용비파야생근연충‘력협비파’화재배충‘조종6호’、‘향비’,대기협록체기인조trnH-psbA기인간격구진행PCR극륭여측서,이용생물신식학방법분석기서렬특정,병구건평과아과내19개속적계통발육수.결과표명:trnH-psbA서렬장323～392 bp(GenBank등록호:KF022254、KF022255、KF022256),G+C함량30.10％～33.13％,공유1개핵감산체환(substitution)화2개삽입/결실(indel);기우tmH-psbA DNA조형마서렬적분자계통진화분석결과표명,평과아과내형성2개대적분지,비파속여석반목속적친연관계최근(평균유전거리위0.055).차결과표명협록체기인trnH-psbA서렬가유효지진행비파속내물충감별급속간분류,시비파속식물DNA조형마연구적표준기인지일.
