草业学报
草業學報
초업학보
PRATACULTURAL SCIENCE
2013年
6期
230-238
,共9页
王丽%张俊莲%张金文%刘玉汇%白江平%余斌%杨宏羽%王蒂
王麗%張俊蓮%張金文%劉玉彙%白江平%餘斌%楊宏羽%王蒂
왕려%장준련%장금문%류옥회%백강평%여빈%양굉우%왕체
拟南芥%高亲和性K+载体蛋白%RT-PCR技术%生物信息学分析
擬南芥%高親和性K+載體蛋白%RT-PCR技術%生物信息學分析
의남개%고친화성K+재체단백%RT-PCR기술%생물신식학분석
Arabidopsis thaliana%high-affinity potassium transporter%RT-PCR%bioinformatic analysis
以NaCl胁迫处理的拟南芥幼苗叶片为材料,用RNA提取试剂盒抽提总RNA,通过RT-PCR技术和DNA序列测定分析,证实获得了拟南芥高亲和性K+载体蛋白基因(AtHKT1)的cDNA序列.该cDNA全长1521 bp,包括506个氨基酸和1个终止密码子序列,且与原序列(accession number AF237672)同源性为99.34％,但与其他科植物HKT1基因同源性较低,注册该基因到GenBank中,注册号为AY685182.利用生物信息学相关软件分析预测AtHKT1基因蛋白质功能和结构,结果发现,该蛋白分子量为57.45 kD,理论等电点为9.33;氨基酸序列中第1～40个氨基酸属信号肽序列;第152～500个氨基酸属Trk H阳离子转运体蛋白保守结构域,并存在蛋白激酶C,酪氨酸蛋白激酶,依赖cAMP/cGMP蛋白激酶磷酸化,糖基化和豆蔻酰化等功能位点;该基因编码的蛋白有10个跨膜结构,N末端、C末端及中部等多个跨膜区具疏水性,符合载体类运输蛋白特点.表明本研究获得了拟南芥AtHKT1基因.
以NaCl脅迫處理的擬南芥幼苗葉片為材料,用RNA提取試劑盒抽提總RNA,通過RT-PCR技術和DNA序列測定分析,證實穫得瞭擬南芥高親和性K+載體蛋白基因(AtHKT1)的cDNA序列.該cDNA全長1521 bp,包括506箇氨基痠和1箇終止密碼子序列,且與原序列(accession number AF237672)同源性為99.34％,但與其他科植物HKT1基因同源性較低,註冊該基因到GenBank中,註冊號為AY685182.利用生物信息學相關軟件分析預測AtHKT1基因蛋白質功能和結構,結果髮現,該蛋白分子量為57.45 kD,理論等電點為9.33;氨基痠序列中第1～40箇氨基痠屬信號肽序列;第152～500箇氨基痠屬Trk H暘離子轉運體蛋白保守結構域,併存在蛋白激酶C,酪氨痠蛋白激酶,依賴cAMP/cGMP蛋白激酶燐痠化,糖基化和豆蔻酰化等功能位點;該基因編碼的蛋白有10箇跨膜結構,N末耑、C末耑及中部等多箇跨膜區具疏水性,符閤載體類運輸蛋白特點.錶明本研究穫得瞭擬南芥AtHKT1基因.
이NaCl협박처리적의남개유묘협편위재료,용RNA제취시제합추제총RNA,통과RT-PCR기술화DNA서렬측정분석,증실획득료의남개고친화성K+재체단백기인(AtHKT1)적cDNA서렬.해cDNA전장1521 bp,포괄506개안기산화1개종지밀마자서렬,차여원서렬(accession number AF237672)동원성위99.34％,단여기타과식물HKT1기인동원성교저,주책해기인도GenBank중,주책호위AY685182.이용생물신식학상관연건분석예측AtHKT1기인단백질공능화결구,결과발현,해단백분자량위57.45 kD,이론등전점위9.33;안기산서렬중제1～40개안기산속신호태서렬;제152～500개안기산속Trk H양리자전운체단백보수결구역,병존재단백격매C,락안산단백격매,의뢰cAMP/cGMP단백격매린산화,당기화화두구선화등공능위점;해기인편마적단백유10개과막결구,N말단、C말단급중부등다개과막구구소수성,부합재체류운수단백특점.표명본연구획득료의남개AtHKT1기인.
