浙江农林大学学报
浙江農林大學學報
절강농림대학학보
JOURNAL OF ZHEJIANG FORESTRY COLLEGE
2013年
1期
1-8
,共8页
杨希宏%黄有军%陈芳芳%黄坚钦
楊希宏%黃有軍%陳芳芳%黃堅欽
양희굉%황유군%진방방%황견흠
植物学%山核桃%CcFLC%序列分析%表达分析
植物學%山覈桃%CcFLC%序列分析%錶達分析
식물학%산핵도%CcFLC%서렬분석%표체분석
根据本课题组对山核桃Carya cathayensis花芽454测序获得的CcFLC基因的2个开放阅读框(ORF)分别设计引物并进行聚合酶链式反应(PCR)扩增,获得开放阅读框大小分别为639 bp和612 bp,编码212个和203个氨基酸,GenBank登录号分别为JQ829074和JQ829075,都具有典型的MADS-box结构域,核苷酸和氨基酸序列同源性分别为78%和67%,5′端高度同源,3′端差异较大.与太行花Taihangia rupestris和梨Pyrus pyrifolia等物种的FLC-like基因的氨基酸序列同源性达到40%~57%.氨基酸疏水性分析显示,它们的羧基端都是疏水性氨基酸,而氨基端是亲水性氨基酸,大部分氨基酸残基是疏水性的.实时定量PCR结果显示:CcFLC基因的2个开放阅读框在山核桃的营养枝的幼茎、幼叶、顶芽,以及短果枝的雌花芽和雄花芽中都有表达,但相对表达量存在较大差异,同一组织中ORF1的表达丰度明显高于ORF2. ORF1表达量在茎中最高,但在叶和雄花芽的表达量最低;ORF2在雌花芽中相对表达量最高,茎中表达量最低.
根據本課題組對山覈桃Carya cathayensis花芽454測序穫得的CcFLC基因的2箇開放閱讀框(ORF)分彆設計引物併進行聚閤酶鏈式反應(PCR)擴增,穫得開放閱讀框大小分彆為639 bp和612 bp,編碼212箇和203箇氨基痠,GenBank登錄號分彆為JQ829074和JQ829075,都具有典型的MADS-box結構域,覈苷痠和氨基痠序列同源性分彆為78%和67%,5′耑高度同源,3′耑差異較大.與太行花Taihangia rupestris和梨Pyrus pyrifolia等物種的FLC-like基因的氨基痠序列同源性達到40%~57%.氨基痠疏水性分析顯示,它們的羧基耑都是疏水性氨基痠,而氨基耑是親水性氨基痠,大部分氨基痠殘基是疏水性的.實時定量PCR結果顯示:CcFLC基因的2箇開放閱讀框在山覈桃的營養枝的幼莖、幼葉、頂芽,以及短果枝的雌花芽和雄花芽中都有錶達,但相對錶達量存在較大差異,同一組織中ORF1的錶達豐度明顯高于ORF2. ORF1錶達量在莖中最高,但在葉和雄花芽的錶達量最低;ORF2在雌花芽中相對錶達量最高,莖中錶達量最低.
근거본과제조대산핵도Carya cathayensis화아454측서획득적CcFLC기인적2개개방열독광(ORF)분별설계인물병진행취합매련식반응(PCR)확증,획득개방열독광대소분별위639 bp화612 bp,편마212개화203개안기산,GenBank등록호분별위JQ829074화JQ829075,도구유전형적MADS-box결구역,핵감산화안기산서렬동원성분별위78%화67%,5′단고도동원,3′단차이교대.여태행화Taihangia rupestris화리Pyrus pyrifolia등물충적FLC-like기인적안기산서렬동원성체도40%~57%.안기산소수성분석현시,타문적최기단도시소수성안기산,이안기단시친수성안기산,대부분안기산잔기시소수성적.실시정량PCR결과현시:CcFLC기인적2개개방열독광재산핵도적영양지적유경、유협、정아,이급단과지적자화아화웅화아중도유표체,단상대표체량존재교대차이,동일조직중ORF1적표체봉도명현고우ORF2. ORF1표체량재경중최고,단재협화웅화아적표체량최저;ORF2재자화아중상대표체량최고,경중표체량최저.