草业学报
草業學報
초업학보
PRATACULTURAL SCIENCE
2013年
4期
170-178
,共9页
姜格格%宋丽莉%郭东林%蔡洪生%郭长虹%束永俊
薑格格%宋麗莉%郭東林%蔡洪生%郭長虹%束永俊
강격격%송려리%곽동림%채홍생%곽장홍%속영준
蒺藜苜蓿%全基因组关联分析%EMMA%基因组选择%岭回归
蒺藜苜蓿%全基因組關聯分析%EMMA%基因組選擇%嶺迴歸
질려목숙%전기인조관련분석%EMMA%기인조선택%령회귀
Medicago truncatula%genome-wide association mapping%efficient mixed model association (EMMA)%genomic selection (GS)%ridge regression
铝毒害是酸性土壤耕种的主要限制因素,每年造成大量作物减产.蒺藜苜蓿是紫花苜蓿的一年生近缘种,广泛分布于世界各地,是紫花苜蓿遗传改良的重要基因资源.本研究利用蒺藜苜蓿群体的耐酸铝性状差异,进行全基因组关联分析,筛选蒺藜苜蓿耐酸铝性状相关的遗传位点,共得到58个与蒺藜苜蓿耐酸铝性状相关的SNP标记.对其周围基因进行功能注释分析,发现这些SNP位点主要参与苜蓿的细胞壁、脂质代谢、环境胁迫响应过程、氧化还原反应过程以及小分子转运等过程.最后,通过基因组选择方法将发掘SNP标记应用到蒺藜苜蓿耐酸铝性状的预测,预测准确性达到0.80,这说明本研究发掘的SNP标记可以用于蒺藜苜蓿及其近缘物种紫花苜蓿耐酸铝性状的遗传改良.
鋁毒害是痠性土壤耕種的主要限製因素,每年造成大量作物減產.蒺藜苜蓿是紫花苜蓿的一年生近緣種,廣汎分佈于世界各地,是紫花苜蓿遺傳改良的重要基因資源.本研究利用蒺藜苜蓿群體的耐痠鋁性狀差異,進行全基因組關聯分析,篩選蒺藜苜蓿耐痠鋁性狀相關的遺傳位點,共得到58箇與蒺藜苜蓿耐痠鋁性狀相關的SNP標記.對其週圍基因進行功能註釋分析,髮現這些SNP位點主要參與苜蓿的細胞壁、脂質代謝、環境脅迫響應過程、氧化還原反應過程以及小分子轉運等過程.最後,通過基因組選擇方法將髮掘SNP標記應用到蒺藜苜蓿耐痠鋁性狀的預測,預測準確性達到0.80,這說明本研究髮掘的SNP標記可以用于蒺藜苜蓿及其近緣物種紫花苜蓿耐痠鋁性狀的遺傳改良.
려독해시산성토양경충적주요한제인소,매년조성대량작물감산.질려목숙시자화목숙적일년생근연충,엄범분포우세계각지,시자화목숙유전개량적중요기인자원.본연구이용질려목숙군체적내산려성상차이,진행전기인조관련분석,사선질려목숙내산려성상상관적유전위점,공득도58개여질려목숙내산려성상상관적SNP표기.대기주위기인진행공능주석분석,발현저사SNP위점주요삼여목숙적세포벽、지질대사、배경협박향응과정、양화환원반응과정이급소분자전운등과정.최후,통과기인조선택방법장발굴SNP표기응용도질려목숙내산려성상적예측,예측준학성체도0.80,저설명본연구발굴적SNP표기가이용우질려목숙급기근연물충자화목숙내산려성상적유전개량.
