海洋科学进展
海洋科學進展
해양과학진전
JOURNAL OF OCEANOGRAPHY OF HUANGHAI & BOHAI SEAS
2013年
1期
145-152
,共8页
适冷杆菌%普遍胁迫蛋白%应激反应%表达分析
適冷桿菌%普遍脅迫蛋白%應激反應%錶達分析
괄랭간균%보편협박단백%응격반응%표체분석
根据南极适冷菌Psychrobacter sp.G基因组测序草图发现并克隆到了1个普遍胁迫蛋白(Universal Stress Protein,USP)基因Usp1141.该基因ORF长462 bp,编码153个氨基酸,蛋白理论分子量为17 kDa,pI为5.23.通过多序列比对发现该USP含有交替排列的4个a螺旋和5个β折叠,以及与ATP结合相关的氨基酸残基,表明该蛋白可能通过与ATP结合而发挥作用.利用实时定量PCR技术对该蛋白在不同胁迫条件下的表达情况进行分析发现,温度变化对Usp1141基因的表达没有显著影响；低盐度(O,15)胁迫会显著抑制其表达,而高盐度(90,120)胁迫则会显著促进其表达；在温度与盐度协同胁迫条件下,当培养基盐度低于菌株生长的最适盐度时,无论温度高低,Usp1141基因的表达均受到抑制,而当培养基盐度高于最适盐度时,无论温度高低,Usp1141基因的表达均会提高.实时定量PCR研究表明,Usp1141基因可能在南极适冷菌Psychrobacter sp.G对环境渗透压变化的适应性中发挥作用.
根據南極適冷菌Psychrobacter sp.G基因組測序草圖髮現併剋隆到瞭1箇普遍脅迫蛋白(Universal Stress Protein,USP)基因Usp1141.該基因ORF長462 bp,編碼153箇氨基痠,蛋白理論分子量為17 kDa,pI為5.23.通過多序列比對髮現該USP含有交替排列的4箇a螺鏇和5箇β摺疊,以及與ATP結閤相關的氨基痠殘基,錶明該蛋白可能通過與ATP結閤而髮揮作用.利用實時定量PCR技術對該蛋白在不同脅迫條件下的錶達情況進行分析髮現,溫度變化對Usp1141基因的錶達沒有顯著影響；低鹽度(O,15)脅迫會顯著抑製其錶達,而高鹽度(90,120)脅迫則會顯著促進其錶達；在溫度與鹽度協同脅迫條件下,噹培養基鹽度低于菌株生長的最適鹽度時,無論溫度高低,Usp1141基因的錶達均受到抑製,而噹培養基鹽度高于最適鹽度時,無論溫度高低,Usp1141基因的錶達均會提高.實時定量PCR研究錶明,Usp1141基因可能在南極適冷菌Psychrobacter sp.G對環境滲透壓變化的適應性中髮揮作用.
근거남겁괄랭균Psychrobacter sp.G기인조측서초도발현병극륭도료1개보편협박단백(Universal Stress Protein,USP)기인Usp1141.해기인ORF장462 bp,편마153개안기산,단백이론분자량위17 kDa,pI위5.23.통과다서렬비대발현해USP함유교체배렬적4개a라선화5개β절첩,이급여ATP결합상관적안기산잔기,표명해단백가능통과여ATP결합이발휘작용.이용실시정량PCR기술대해단백재불동협박조건하적표체정황진행분석발현,온도변화대Usp1141기인적표체몰유현저영향；저염도(O,15)협박회현저억제기표체,이고염도(90,120)협박칙회현저촉진기표체；재온도여염도협동협박조건하,당배양기염도저우균주생장적최괄염도시,무론온도고저,Usp1141기인적표체균수도억제,이당배양기염도고우최괄염도시,무론온도고저,Usp1141기인적표체균회제고.실시정량PCR연구표명,Usp1141기인가능재남겁괄랭균Psychrobacter sp.G대배경삼투압변화적괄응성중발휘작용.
