CAJ | 학술논문

目的:结合生物信息学分析手段,筛选乳腺癌转移相关微RNA (microRNA,miRNA)-200c调控的基因网络.方法:采用Affymetrix(R) miRNA生物芯片分析12株乳腺细胞中差异表达的miRNA;应用脂质体转染法将miR-200c模拟物(mimic)转入4株高转移性的乳腺癌细胞株(BT549、HS578T、MDA-MB-231和SUM159PT)中,再用Affymetrix(R) mRNA生物芯片检测转染miR-200c mimic后高转移性乳腺癌细胞株中差异表达的基因.采用生物分子功能注释系统(CapitalBio Molecule Annotation System,MAS),筛选miR-200c调控的信号通路与基因网络.结果:12个乳腺细胞株中筛选出9个差异表达的miRNA (P＜0.01,倍数值≥20或≤-20),其中以miR-200c在高转移性乳腺癌细胞株中下调幅度最显著.4个转染miR-200c mimic的乳腺癌细胞株中共有33个共上调基因及13个共下调基因.实时荧光定量-PCR与蛋白质印迹法验证结果显示,共调基因锌指E框结合同源框1(zinc finger E-box binding homeobox1,ZEB1)mRNA和蛋白在4个转染细胞株中均下调.MAS生物信息学分析结果显示,转染miR-200c mimic的乳腺癌细胞株中共有的差异表达基因相关信号通路包括嗅觉传导(olfactory transduction)通路、细胞因子-细胞因子受体关联(cytokine-cytokine receptor interaction)通路和细胞黏附分子(cell adhesion molecules,CAMs)通路等,不同的信号通路可以通过共调基因相互联系,在特定的信号通路中,共调基因间也存在密切的相互联系.结论:以高通量生物芯片检测为基础,运用生物信息学分析手段,多元化筛选获得miR-200c 调控的基因网络,为后续展开miR-200c作用机制的研究提供了明确的方向.
목적:결합생물신식학분석수단,사선유선암전이상관미RNA (microRNA,miRNA)-200c조공적기인망락.방법:채용Affymetrix(R) miRNA생물심편분석12주유선세포중차이표체적miRNA;응용지질체전염법장miR-200c모의물(mimic)전입4주고전이성적유선암세포주(BT549、HS578T、MDA-MB-231화SUM159PT)중,재용Affymetrix(R) mRNA생물심편검측전염miR-200c mimic후고전이성유선암세포주중차이표체적기인.채용생물분자공능주석계통(CapitalBio Molecule Annotation System,MAS),사선miR-200c조공적신호통로여기인망락.결과:12개유선세포주중사선출9개차이표체적miRNA (P＜0.01,배수치≥20혹≤-20),기중이miR-200c재고전이성유선암세포주중하조폭도최현저.4개전염miR-200c mimic적유선암세포주중공유33개공상조기인급13개공하조기인.실시형광정량-PCR여단백질인적법험증결과현시,공조기인자지E광결합동원광1(zinc finger E-box binding homeobox1,ZEB1)mRNA화단백재4개전염세포주중균하조.MAS생물신식학분석결과현시,전염miR-200c mimic적유선암세포주중공유적차이표체기인상관신호통로포괄후각전도(olfactory transduction)통로、세포인자-세포인자수체관련(cytokine-cytokine receptor interaction)통로화세포점부분자(cell adhesion molecules,CAMs)통로등,불동적신호통로가이통과공조기인상호련계,재특정적신호통로중,공조기인간야존재밀절적상호련계.결론:이고통량생물심편검측위기출,운용생물신식학분석수단,다원화사선획득miR-200c 조공적기인망락,위후속전개miR-200c작용궤제적연구제공료명학적방향.