现代仪器与医疗
現代儀器與醫療
현대의기여의료
Modern Instrument and Medical Treatment
2013年
1期
1-4
,共4页
黄于艺%陈惠芳%何颖%邹泽红%陶爱林
黃于藝%陳惠芳%何穎%鄒澤紅%陶愛林
황우예%진혜방%하영%추택홍%도애림
中国龙虾%Pan s 1%抗原表位%进化分析
中國龍蝦%Pan s 1%抗原錶位%進化分析
중국룡하%Pan s 1%항원표위%진화분석
Panulirus stimpsoni%Pan s 1%Epitopes%The evolutionary analysis
在Uniprot数据库中获得中国龙虾过敏原Pan s1蛋白序列,使用DNAStar 和NetMHC Ⅱ分别预测B细胞和T细胞表位,并对其进行抗原性评分;使用SwissModel软件生成其三维结构,并利用Ramachandran plot分析进行模型有效性评估.在Uniprot数据库搜集不同种类的虾蟹原肌球蛋白序列,利用MEGA5.1用JTT+G模型构建ML(Maximum Likelihood)进化树.结果显示,中国龙虾过敏原Pans 1三维结构为2条相互缠绕的α-螺旋.Pans 1的B/T细胞共有抗原表位区域为81～95,146～157.同体型大小的虾蟹类之间,可能更为容易产生种群间的交叉过敏反应.
在Uniprot數據庫中穫得中國龍蝦過敏原Pan s1蛋白序列,使用DNAStar 和NetMHC Ⅱ分彆預測B細胞和T細胞錶位,併對其進行抗原性評分;使用SwissModel軟件生成其三維結構,併利用Ramachandran plot分析進行模型有效性評估.在Uniprot數據庫搜集不同種類的蝦蟹原肌毬蛋白序列,利用MEGA5.1用JTT+G模型構建ML(Maximum Likelihood)進化樹.結果顯示,中國龍蝦過敏原Pans 1三維結構為2條相互纏繞的α-螺鏇.Pans 1的B/T細胞共有抗原錶位區域為81～95,146～157.同體型大小的蝦蟹類之間,可能更為容易產生種群間的交扠過敏反應.
재Uniprot수거고중획득중국룡하과민원Pan s1단백서렬,사용DNAStar 화NetMHC Ⅱ분별예측B세포화T세포표위,병대기진행항원성평분;사용SwissModel연건생성기삼유결구,병이용Ramachandran plot분석진행모형유효성평고.재Uniprot수거고수집불동충류적하해원기구단백서렬,이용MEGA5.1용JTT+G모형구건ML(Maximum Likelihood)진화수.결과현시,중국룡하과민원Pans 1삼유결구위2조상호전요적α-라선.Pans 1적B/T세포공유항원표위구역위81～95,146～157.동체형대소적하해류지간,가능경위용역산생충군간적교차과민반응.
