江西林业科技
江西林業科技
강서임업과기
JIANGXI FORESTRY SCIENCE AND TECHNOLOGY
2013年
4期
1-5
,共5页
普通油茶%茶%Ks%进化%转录组
普通油茶%茶%Ks%進化%轉錄組
보통유다%다%Ks%진화%전록조
为研究山茶属(Camellia)的山茶亚属(Subgen.Camellia)与茶亚属(Subgen.Thea)分化的时间,利用普通油茶(C.oleifera)叶转录组测序数据及茶(C.sinensis)的公共EST序列进行比较基因组学与进化分析,通过对同源基因对的Ks值和Ka/Ks值的统计分析,结果表明,同源基因对的平均Ks值为0.0311,山茶亚属与荼亚属的分化时间约为552万年前;此外,有131对同源基因的Ka/Ks值大于1,为两个亚属分化以来快速进化的基因.
為研究山茶屬(Camellia)的山茶亞屬(Subgen.Camellia)與茶亞屬(Subgen.Thea)分化的時間,利用普通油茶(C.oleifera)葉轉錄組測序數據及茶(C.sinensis)的公共EST序列進行比較基因組學與進化分析,通過對同源基因對的Ks值和Ka/Ks值的統計分析,結果錶明,同源基因對的平均Ks值為0.0311,山茶亞屬與荼亞屬的分化時間約為552萬年前;此外,有131對同源基因的Ka/Ks值大于1,為兩箇亞屬分化以來快速進化的基因.
위연구산다속(Camellia)적산다아속(Subgen.Camellia)여다아속(Subgen.Thea)분화적시간,이용보통유다(C.oleifera)협전록조측서수거급다(C.sinensis)적공공EST서렬진행비교기인조학여진화분석,통과대동원기인대적Ks치화Ka/Ks치적통계분석,결과표명,동원기인대적평균Ks치위0.0311,산다아속여도아속적분화시간약위552만년전;차외,유131대동원기인적Ka/Ks치대우1,위량개아속분화이래쾌속진화적기인.
