CAJ | 학술논문

辣椒素是由辣椒果实产生的一组化合物,被广泛应用于许多领域,尤其是医药行业.辣椒素生物合成途径还没有被清楚地确定.为了解更多辣椒素生物合成的知识,我们对辣椒(Capsicum frutescensL.)胎座和果皮的混合材料进行了转录组测序.并使用不同的拼接软件对各拼接参数的影响进行了评估,最终获得了转录组数据de novo拼接的最佳策略之一.我们利用Trinity软件得到共54 045条高质量unigenes(转录物).约92.65％的unigenes与马铃薯、番茄和辣椒(C.annuum)ESTs数据库公共蛋白序列和基因组有相似性.我们预测到了3个新的结构基因(DHAD,TD,PAT),填补了由Mazourek提出的辣椒素分子合成途径中的空缺,并且以KEGG(京东基因与基因组百科全书)分析为基础,鉴定到了参与辣椒素生物合成新的候选基因.大量的SSR(简单重复序列)和SNP(单核苷酸多态性)标记在C.frutescens和C.annuum序列中被预测到,这些标记可在识别辣椒群体多态性方面提供帮助.这些数据将为辣椒素生物合成途径及相关研究提供新的思路.此外,我们的转录组de novo拼接策略也可用于其他大量类似研究中.
랄초소시유랄초과실산생적일조화합물,피엄범응용우허다영역,우기시의약행업.랄초소생물합성도경환몰유피청초지학정.위료해경다랄초소생물합성적지식,아문대랄초(Capsicum frutescensL.)태좌화과피적혼합재료진행료전록조측서.병사용불동적병접연건대각병접삼수적영향진행료평고,최종획득료전록조수거de novo병접적최가책략지일.아문이용Trinity연건득도공54 045조고질량unigenes(전록물).약92.65％적unigenes여마령서、번가화랄초(C.annuum)ESTs수거고공공단백서렬화기인조유상사성.아문예측도료3개신적결구기인(DHAD,TD,PAT),전보료유Mazourek제출적랄초소분자합성도경중적공결,병차이KEGG(경동기인여기인조백과전서)분석위기출,감정도료삼여랄초소생물합성신적후선기인.대량적SSR(간단중복서렬)화SNP(단핵감산다태성)표기재C.frutescens화C.annuum서렬중피예측도,저사표기가재식별랄초군체다태성방면제공방조.저사수거장위랄초소생물합성도경급상관연구제공신적사로.차외,아문적전록조de novo병접책략야가용우기타대량유사연구중.