西北植物学报
西北植物學報
서북식물학보
ACTA BOTANICA BOREALI-OCCIDENTALIA SINICA
2014年
3期
431-437
,共7页
无苞芥%类钙调素蛋白13%基因表达%抗逆
無苞芥%類鈣調素蛋白13%基因錶達%抗逆
무포개%류개조소단백13%기인표체%항역
Olimarabidopsis pumila%Calmodulin-like protein 13%gene expression%stress tolerance
通过对无苞芥幼苗cDNA文库的随机克隆测序分析,获得1条与拟南芥编码类钙调素13(calmodulinlike13,CML13)高度相似的EST(GenBank登录号为JZ152285).利用RT-PCR技术从无苞芥cDNA中克隆了该基因,命名为OpCML13,该基因开放阅读框(ORF)为447 bp,编码148个氨基酸.生物信息学分析表明,OpCML13蛋白的二级结构含有4个Ca2+结合基序(EF-hands)结构,是一个亲水蛋白,无信号肽,无跨膜区域,为非跨膜蛋白;同源建模发现该蛋白包含8个α-螺旋结构和10个β-转角.系统进化树分析表明,OpCML 13编码产物与拟南芥AtCML13和AtCML14进化关系较近,属于同一进化分支.半定量RT-PCR结果显示,OpCML 13基因在无苞芥的不同组织中都有表达,在根中表达量最高;高盐胁迫处理6~24 h,Op CML 13基因的表达明显增强,随后逐渐恢复正常表达水平;低温、干旱和ABA处理6h后基因表达明显上调,并且一直保持较高的表达水平.研究表明,OpCML13基因在无苞芥逆境胁迫中可能起着重要作用.
通過對無苞芥幼苗cDNA文庫的隨機剋隆測序分析,穫得1條與擬南芥編碼類鈣調素13(calmodulinlike13,CML13)高度相似的EST(GenBank登錄號為JZ152285).利用RT-PCR技術從無苞芥cDNA中剋隆瞭該基因,命名為OpCML13,該基因開放閱讀框(ORF)為447 bp,編碼148箇氨基痠.生物信息學分析錶明,OpCML13蛋白的二級結構含有4箇Ca2+結閤基序(EF-hands)結構,是一箇親水蛋白,無信號肽,無跨膜區域,為非跨膜蛋白;同源建模髮現該蛋白包含8箇α-螺鏇結構和10箇β-轉角.繫統進化樹分析錶明,OpCML 13編碼產物與擬南芥AtCML13和AtCML14進化關繫較近,屬于同一進化分支.半定量RT-PCR結果顯示,OpCML 13基因在無苞芥的不同組織中都有錶達,在根中錶達量最高;高鹽脅迫處理6~24 h,Op CML 13基因的錶達明顯增彊,隨後逐漸恢複正常錶達水平;低溫、榦旱和ABA處理6h後基因錶達明顯上調,併且一直保持較高的錶達水平.研究錶明,OpCML13基因在無苞芥逆境脅迫中可能起著重要作用.
통과대무포개유묘cDNA문고적수궤극륭측서분석,획득1조여의남개편마류개조소13(calmodulinlike13,CML13)고도상사적EST(GenBank등록호위JZ152285).이용RT-PCR기술종무포개cDNA중극륭료해기인,명명위OpCML13,해기인개방열독광(ORF)위447 bp,편마148개안기산.생물신식학분석표명,OpCML13단백적이급결구함유4개Ca2+결합기서(EF-hands)결구,시일개친수단백,무신호태,무과막구역,위비과막단백;동원건모발현해단백포함8개α-라선결구화10개β-전각.계통진화수분석표명,OpCML 13편마산물여의남개AtCML13화AtCML14진화관계교근,속우동일진화분지.반정량RT-PCR결과현시,OpCML 13기인재무포개적불동조직중도유표체,재근중표체량최고;고염협박처리6~24 h,Op CML 13기인적표체명현증강,수후축점회복정상표체수평;저온、간한화ABA처리6h후기인표체명현상조,병차일직보지교고적표체수평.연구표명,OpCML13기인재무포개역경협박중가능기착중요작용.