南京林业大学学报（自然科学版）
南京林業大學學報（自然科學版）
남경임업대학학보（자연과학판）
JOURNAL OF NANJING FORESTRY UNIVERSITY(NATURAL SCIENCE EDITION)
2013年
4期
8-12
,共5页
银杏萜内酯%牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶(GGPS)%蛋白质结构%生物信息学分析
銀杏萜內酯%牻牛兒基牻牛兒基焦燐痠閤成酶(GGPS)%蛋白質結構%生物信息學分析
은행첩내지%방우인기방우인기초린산합성매(GGPS)%단백질결구%생물신식학분석
ginkgolides%geranylgeranyl pyrophosphate synthase(GGPS)%protein structure%bioinformatics analysis
利用RACE技术克隆并获得了银杏牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶基因(GbGGPS基因).银杏GbGGPS基因的cDNA全长为1 641 bp,含有1个1 176 bp的可读框,编码391个氨基酸序列.生物信息学预测GbGGPS蛋白的分子质量为42.51 ku,理论等电点为5.98,N端有叶绿体信号肽,其二级结构主要由α-螺旋和无规则卷曲组成.蛋白质同源分析表明,GbGGPS含有多聚异戊二烯基合成酶家族中保守的5个特征性结构域和2个富含天冬氨酸的区域.同源建模分析显示GbGGPS序列与薄荷GGPS蛋白的三维结构及活性位点高度相似.系统进化分析表明,银杏GGPS蛋白归属植物进化支,且与加拿大红豆杉、挪威云杉、北美冷杉的GGPS蛋白归为同一分支.
利用RACE技術剋隆併穫得瞭銀杏牻牛兒基牻牛兒基焦燐痠閤成酶基因(GbGGPS基因).銀杏GbGGPS基因的cDNA全長為1 641 bp,含有1箇1 176 bp的可讀框,編碼391箇氨基痠序列.生物信息學預測GbGGPS蛋白的分子質量為42.51 ku,理論等電點為5.98,N耑有葉綠體信號肽,其二級結構主要由α-螺鏇和無規則捲麯組成.蛋白質同源分析錶明,GbGGPS含有多聚異戊二烯基閤成酶傢族中保守的5箇特徵性結構域和2箇富含天鼕氨痠的區域.同源建模分析顯示GbGGPS序列與薄荷GGPS蛋白的三維結構及活性位點高度相似.繫統進化分析錶明,銀杏GGPS蛋白歸屬植物進化支,且與加拿大紅豆杉、挪威雲杉、北美冷杉的GGPS蛋白歸為同一分支.
이용RACE기술극륭병획득료은행방우인기방우인기초린산합성매기인(GbGGPS기인).은행GbGGPS기인적cDNA전장위1 641 bp,함유1개1 176 bp적가독광,편마391개안기산서렬.생물신식학예측GbGGPS단백적분자질량위42.51 ku,이론등전점위5.98,N단유협록체신호태,기이급결구주요유α-라선화무규칙권곡조성.단백질동원분석표명,GbGGPS함유다취이무이희기합성매가족중보수적5개특정성결구역화2개부함천동안산적구역.동원건모분석현시GbGGPS서렬여박하GGPS단백적삼유결구급활성위점고도상사.계통진화분석표명,은행GGPS단백귀속식물진화지,차여가나대홍두삼、나위운삼、북미랭삼적GGPS단백귀위동일분지.
