西北植物学报
西北植物學報
서북식물학보
ACTA BOTANICA BOREALI-OCCIDENTALIA SINICA
2013年
1期
43-47
,共5页
郝海婷%李唯%殷恒霞%石勇%刘源%闫成才
郝海婷%李唯%慇恆霞%石勇%劉源%閆成纔
학해정%리유%은항하%석용%류원%염성재
蚓果芥%乙烯受体%ETR1%基因克隆%进化分析
蚓果芥%乙烯受體%ETR1%基因剋隆%進化分析
인과개%을희수체%ETR1%기인극륭%진화분석
采用已报道的十字花科植物乙烯受体基因(Ethylene Receptor 1,ETR1)通用引物,以蚓果芥基因组DNA为模板,经PCR分析BhETR1的多态性,进而从分子水平上阐明蚓果芥的进化特征.结果表明:(1)已克隆得到的14条ETR1基因序列,长度为1 644~1 661 bp;经Bioedit软件比对,14条核苷酸序列之间相似性为93%~98%,蛋白氨基酸序列相似度为78%;采用DnaSP v5程序分别统计BhETR1序列多态性,发现14条BhETR1序列形成了14种单倍型.(2)从GenBank数据库下载蚓果芥近缘物种ETR1序列进行进化分析,系统发育分析表明蚓果芥14条ETR1序列形成3大分支;根据分支进化关系,每支中分别选取克隆2(c2)、克隆29(c29)、克隆35(c35)与拟南芥ETR1(AtETR1)和琴叶鼠耳芥ETR1(AlETR1)的序列进行比对,其一致性均为78%,说明BhETR1是一个乙烯受体类似(ETR1-like)基因,而蚓果芥自身14条序列的高度异质性表明蚓果芥的遗传背景相对复杂.
採用已報道的十字花科植物乙烯受體基因(Ethylene Receptor 1,ETR1)通用引物,以蚓果芥基因組DNA為模闆,經PCR分析BhETR1的多態性,進而從分子水平上闡明蚓果芥的進化特徵.結果錶明:(1)已剋隆得到的14條ETR1基因序列,長度為1 644~1 661 bp;經Bioedit軟件比對,14條覈苷痠序列之間相似性為93%~98%,蛋白氨基痠序列相似度為78%;採用DnaSP v5程序分彆統計BhETR1序列多態性,髮現14條BhETR1序列形成瞭14種單倍型.(2)從GenBank數據庫下載蚓果芥近緣物種ETR1序列進行進化分析,繫統髮育分析錶明蚓果芥14條ETR1序列形成3大分支;根據分支進化關繫,每支中分彆選取剋隆2(c2)、剋隆29(c29)、剋隆35(c35)與擬南芥ETR1(AtETR1)和琴葉鼠耳芥ETR1(AlETR1)的序列進行比對,其一緻性均為78%,說明BhETR1是一箇乙烯受體類似(ETR1-like)基因,而蚓果芥自身14條序列的高度異質性錶明蚓果芥的遺傳揹景相對複雜.
채용이보도적십자화과식물을희수체기인(Ethylene Receptor 1,ETR1)통용인물,이인과개기인조DNA위모판,경PCR분석BhETR1적다태성,진이종분자수평상천명인과개적진화특정.결과표명:(1)이극륭득도적14조ETR1기인서렬,장도위1 644~1 661 bp;경Bioedit연건비대,14조핵감산서렬지간상사성위93%~98%,단백안기산서렬상사도위78%;채용DnaSP v5정서분별통계BhETR1서렬다태성,발현14조BhETR1서렬형성료14충단배형.(2)종GenBank수거고하재인과개근연물충ETR1서렬진행진화분석,계통발육분석표명인과개14조ETR1서렬형성3대분지;근거분지진화관계,매지중분별선취극륭2(c2)、극륭29(c29)、극륭35(c35)여의남개ETR1(AtETR1)화금협서이개ETR1(AlETR1)적서렬진행비대,기일치성균위78%,설명BhETR1시일개을희수체유사(ETR1-like)기인,이인과개자신14조서렬적고도이질성표명인과개적유전배경상대복잡.