生物技术
生物技術
생물기술
BIOTECHNOLOGY
2013年
1期
42-45
,共4页
刘仲娜%柴志欣%曾贤彬%钟金城
劉仲娜%柴誌訢%曾賢彬%鐘金城
류중나%시지흔%증현빈%종금성
牦牛%EST%电子克隆%CAPN2基因
牦牛%EST%電子剋隆%CAPN2基因
모우%EST%전자극륭%CAPN2기인
目的:对牦牛CAPN2基因进行电子克隆和序列分析,以期为进一步研究牦牛该基因与其肉质性状相关性以及基因结构和表达奠定理论基础.方法:利用人的CAPNA2基因cDNA序列为探针,在EST数据库进行同源性筛选,运用CAP3进行拼接得到完整序列并结合生物信息学进行序列分析.结果:牦牛CAPN2基因全长3 200bp,包含一个2 103bp的开放阅读框,共编码700个氨基酸;牦牛CAPN2的核苷酸序列与普通牛、羊、马、猪、小鼠、鸡、人相应序列间的一致性分别为99%、97%、90%、87%、85%、79%、90%.经聚类分析,牦牛首先与普通牛聚在一起,然后与羊、猪聚为一类;人与小鼠聚为一类;这两类相聚为一大类后,再依次与马、鸡相聚,其结果与以往的生物学分类结果一致.牦牛CAPN2基因编码蛋白的分子式为C3569H5503N255O1082S26,相对分子质量为79 935.2,理论等电点PI为4.86.结论:牦牛与普通牛、羊、马、猪、小鼠、鸡、人在CAPN-2基因的编码序列具有较高有一致性.该基因编码的蛋白为位于细胞质中的水溶性蛋白.
目的:對牦牛CAPN2基因進行電子剋隆和序列分析,以期為進一步研究牦牛該基因與其肉質性狀相關性以及基因結構和錶達奠定理論基礎.方法:利用人的CAPNA2基因cDNA序列為探針,在EST數據庫進行同源性篩選,運用CAP3進行拼接得到完整序列併結閤生物信息學進行序列分析.結果:牦牛CAPN2基因全長3 200bp,包含一箇2 103bp的開放閱讀框,共編碼700箇氨基痠;牦牛CAPN2的覈苷痠序列與普通牛、羊、馬、豬、小鼠、鷄、人相應序列間的一緻性分彆為99%、97%、90%、87%、85%、79%、90%.經聚類分析,牦牛首先與普通牛聚在一起,然後與羊、豬聚為一類;人與小鼠聚為一類;這兩類相聚為一大類後,再依次與馬、鷄相聚,其結果與以往的生物學分類結果一緻.牦牛CAPN2基因編碼蛋白的分子式為C3569H5503N255O1082S26,相對分子質量為79 935.2,理論等電點PI為4.86.結論:牦牛與普通牛、羊、馬、豬、小鼠、鷄、人在CAPN-2基因的編碼序列具有較高有一緻性.該基因編碼的蛋白為位于細胞質中的水溶性蛋白.
목적:대모우CAPN2기인진행전자극륭화서렬분석,이기위진일보연구모우해기인여기육질성상상관성이급기인결구화표체전정이론기출.방법:이용인적CAPNA2기인cDNA서렬위탐침,재EST수거고진행동원성사선,운용CAP3진행병접득도완정서렬병결합생물신식학진행서렬분석.결과:모우CAPN2기인전장3 200bp,포함일개2 103bp적개방열독광,공편마700개안기산;모우CAPN2적핵감산서렬여보통우、양、마、저、소서、계、인상응서렬간적일치성분별위99%、97%、90%、87%、85%、79%、90%.경취류분석,모우수선여보통우취재일기,연후여양、저취위일류;인여소서취위일류;저량류상취위일대류후,재의차여마、계상취,기결과여이왕적생물학분류결과일치.모우CAPN2기인편마단백적분자식위C3569H5503N255O1082S26,상대분자질량위79 935.2,이론등전점PI위4.86.결론:모우여보통우、양、마、저、소서、계、인재CAPN-2기인적편마서렬구유교고유일치성.해기인편마적단백위위우세포질중적수용성단백.