温州医学院学报
溫州醫學院學報
온주의학원학보
JOURNAL OF WENZHOU MEDICAL COLLEGE
2013年
11期
706-710
,共5页
金劲激%丁玉杰%王冰冰%侯柏龙%张丽芳%朱冠保
金勁激%丁玉傑%王冰冰%侯柏龍%張麗芳%硃冠保
금경격%정옥걸%왕빙빙%후백룡%장려방%주관보
黑色素瘤抗原A家族%黑色素瘤抗原A1%B细胞表位%共同表位
黑色素瘤抗原A傢族%黑色素瘤抗原A1%B細胞錶位%共同錶位
흑색소류항원A가족%흑색소류항원A1%B세포표위%공동표위
melanoma antigen A (MAGE-A) subfamily%melanoma antigen A1%B-cell epitope%common epitope
目的:预测和筛选黑色素瘤抗原A(MAGE-A)家族抗原的共同B细胞表位.方法:以MAGE-A1的全长氨基酸序列为基础,利用生物信息学软件,采用Hopp&Woods的亲水性方案、Zimmerman极性参数和Jameson-Wolf抗原指数方案和Emini表面可及性方案等,结合MAGE-A1的二级结构与其柔性区域及跨膜区域对MAGE-A1的优势B表位区段进行综合分析,进一步运用抗原指数分析预测MAGE-A1的B细胞表位,并将其与MAGE-A家族中其他成员(MAGE-A2至A12)进行比对,以预测MAGE-A家族抗原的共同B细胞表位.结果:MAGE-A1的全长为309个氨基酸,相对分子质量为46 kDa,为可溶性蛋白.经综合分析,其B细胞优势表位可能存在于氨基酸序列N端的9~14,84 ~ 88,118 ~124,160 ~ 165,208 ~ 214,233 ~ 240区段;经与MAGE-A家族中其他成员的氨基酸序列比对,MAGE-A1的9~14,84 ~ 88,118~ 124及233 ~240区段,即HCKPEE,EEEGP,RAREPVTK,GEPRKLLT肽段可能为MAGE-A家族抗原共同B细胞优势表位.结论:利用生物信息学预测发现MAGE-A1的优势B细胞表位中,9~ 14,84 ~ 88,118 ~ 124及233 ~ 240区段可能为MAGE-A家族抗原的共同B细胞表位,可为表位疫苗的研制等提供理论依据.
目的:預測和篩選黑色素瘤抗原A(MAGE-A)傢族抗原的共同B細胞錶位.方法:以MAGE-A1的全長氨基痠序列為基礎,利用生物信息學軟件,採用Hopp&Woods的親水性方案、Zimmerman極性參數和Jameson-Wolf抗原指數方案和Emini錶麵可及性方案等,結閤MAGE-A1的二級結構與其柔性區域及跨膜區域對MAGE-A1的優勢B錶位區段進行綜閤分析,進一步運用抗原指數分析預測MAGE-A1的B細胞錶位,併將其與MAGE-A傢族中其他成員(MAGE-A2至A12)進行比對,以預測MAGE-A傢族抗原的共同B細胞錶位.結果:MAGE-A1的全長為309箇氨基痠,相對分子質量為46 kDa,為可溶性蛋白.經綜閤分析,其B細胞優勢錶位可能存在于氨基痠序列N耑的9~14,84 ~ 88,118 ~124,160 ~ 165,208 ~ 214,233 ~ 240區段;經與MAGE-A傢族中其他成員的氨基痠序列比對,MAGE-A1的9~14,84 ~ 88,118~ 124及233 ~240區段,即HCKPEE,EEEGP,RAREPVTK,GEPRKLLT肽段可能為MAGE-A傢族抗原共同B細胞優勢錶位.結論:利用生物信息學預測髮現MAGE-A1的優勢B細胞錶位中,9~ 14,84 ~ 88,118 ~ 124及233 ~ 240區段可能為MAGE-A傢族抗原的共同B細胞錶位,可為錶位疫苗的研製等提供理論依據.
목적:예측화사선흑색소류항원A(MAGE-A)가족항원적공동B세포표위.방법:이MAGE-A1적전장안기산서렬위기출,이용생물신식학연건,채용Hopp&Woods적친수성방안、Zimmerman겁성삼수화Jameson-Wolf항원지수방안화Emini표면가급성방안등,결합MAGE-A1적이급결구여기유성구역급과막구역대MAGE-A1적우세B표위구단진행종합분석,진일보운용항원지수분석예측MAGE-A1적B세포표위,병장기여MAGE-A가족중기타성원(MAGE-A2지A12)진행비대,이예측MAGE-A가족항원적공동B세포표위.결과:MAGE-A1적전장위309개안기산,상대분자질량위46 kDa,위가용성단백.경종합분석,기B세포우세표위가능존재우안기산서렬N단적9~14,84 ~ 88,118 ~124,160 ~ 165,208 ~ 214,233 ~ 240구단;경여MAGE-A가족중기타성원적안기산서렬비대,MAGE-A1적9~14,84 ~ 88,118~ 124급233 ~240구단,즉HCKPEE,EEEGP,RAREPVTK,GEPRKLLT태단가능위MAGE-A가족항원공동B세포우세표위.결론:이용생물신식학예측발현MAGE-A1적우세B세포표위중,9~ 14,84 ~ 88,118 ~ 124급233 ~ 240구단가능위MAGE-A가족항원적공동B세포표위,가위표위역묘적연제등제공이론의거.