淡水渔业
淡水漁業
담수어업
FRESHWATER FISHERIES
2013年
6期
19-28
,共10页
柏盈盈%贾智英%葛会争%李池陶%张秋军%石连玉
柏盈盈%賈智英%葛會爭%李池陶%張鞦軍%石連玉
백영영%가지영%갈회쟁%리지도%장추군%석련옥
TLR9基因%SNP%鲤(Cyprinus carpio)%遗传多样性
TLR9基因%SNP%鯉(Cyprinus carpio)%遺傳多樣性
TLR9기인%SNP%리(Cyprinus carpio)%유전다양성
TLR9 gene%SNP%Cyprinus carpio%genetic diversity
采用直接测序法对7种鲤(Cyprinus carpio):德国镜鲤(C.carpio L.mirror)、松荷鲤(C.carpio L)、松浦鲤(C.carpio var.Songpu)、易捕鲤(C.carpio var.Yibu)、大头鲤(C.pellegrini T.)、松浦镜鲤(C.carpio var.Songpu mirror)和野鲤(C.carpio haematoperus)TLR9基因的SNP位点的多态性和遗传多样性进行了研究.结果显示,在292个个体中共检测出37个碱基变异位点,均位于基因外显子区域,占整个片段长度的0.84%,其中20个SNP位点为非同义突变.野鲤的碱基突变位点最多,松浦镜鲤的碱基突变位点最少(P<0.05),其他各品种间无显著性差异(P>0.05);野鲤的非同义突变位点最多,松浦镜鲤的非同义突变位点最少(P<0.05),其他各品种间无显著性差异(P>0.05).稀有等位基因频率大于0.05时,经Hardy-Weinberg卡方检验结果显示各品种中除了德国镜鲤和松浦镜鲤外,大多数位点都处于平衡状态(P>0.05);各品种的PIC值处于中低度多态水平(PIC<0.5).卡方检验分析结果显示,各品种间共有24个位点的基因型频率存在显著性差异(P<0.05),其中11个位点为非同义突变位点,这可能是影响TLR9基因免疫应答功能的原因.
採用直接測序法對7種鯉(Cyprinus carpio):德國鏡鯉(C.carpio L.mirror)、鬆荷鯉(C.carpio L)、鬆浦鯉(C.carpio var.Songpu)、易捕鯉(C.carpio var.Yibu)、大頭鯉(C.pellegrini T.)、鬆浦鏡鯉(C.carpio var.Songpu mirror)和野鯉(C.carpio haematoperus)TLR9基因的SNP位點的多態性和遺傳多樣性進行瞭研究.結果顯示,在292箇箇體中共檢測齣37箇堿基變異位點,均位于基因外顯子區域,佔整箇片段長度的0.84%,其中20箇SNP位點為非同義突變.野鯉的堿基突變位點最多,鬆浦鏡鯉的堿基突變位點最少(P<0.05),其他各品種間無顯著性差異(P>0.05);野鯉的非同義突變位點最多,鬆浦鏡鯉的非同義突變位點最少(P<0.05),其他各品種間無顯著性差異(P>0.05).稀有等位基因頻率大于0.05時,經Hardy-Weinberg卡方檢驗結果顯示各品種中除瞭德國鏡鯉和鬆浦鏡鯉外,大多數位點都處于平衡狀態(P>0.05);各品種的PIC值處于中低度多態水平(PIC<0.5).卡方檢驗分析結果顯示,各品種間共有24箇位點的基因型頻率存在顯著性差異(P<0.05),其中11箇位點為非同義突變位點,這可能是影響TLR9基因免疫應答功能的原因.
채용직접측서법대7충리(Cyprinus carpio):덕국경리(C.carpio L.mirror)、송하리(C.carpio L)、송포리(C.carpio var.Songpu)、역포리(C.carpio var.Yibu)、대두리(C.pellegrini T.)、송포경리(C.carpio var.Songpu mirror)화야리(C.carpio haematoperus)TLR9기인적SNP위점적다태성화유전다양성진행료연구.결과현시,재292개개체중공검측출37개감기변이위점,균위우기인외현자구역,점정개편단장도적0.84%,기중20개SNP위점위비동의돌변.야리적감기돌변위점최다,송포경리적감기돌변위점최소(P<0.05),기타각품충간무현저성차이(P>0.05);야리적비동의돌변위점최다,송포경리적비동의돌변위점최소(P<0.05),기타각품충간무현저성차이(P>0.05).희유등위기인빈솔대우0.05시,경Hardy-Weinberg잡방검험결과현시각품충중제료덕국경리화송포경리외,대다수위점도처우평형상태(P>0.05);각품충적PIC치처우중저도다태수평(PIC<0.5).잡방검험분석결과현시,각품충간공유24개위점적기인형빈솔존재현저성차이(P<0.05),기중11개위점위비동의돌변위점,저가능시영향TLR9기인면역응답공능적원인.