浙江农业学报
浙江農業學報
절강농업학보
ACTA AGRICULTURAE ZHEJIANGENSIS
2013年
5期
980-986
,共7页
蒋明%苗立祥%张豫超%管铭%潘小翠
蔣明%苗立祥%張豫超%管銘%潘小翠
장명%묘립상%장예초%관명%반소취
大白菜%WRKY转录因子%全基因组%序列分析
大白菜%WRKY轉錄因子%全基因組%序列分析
대백채%WRKY전록인자%전기인조%서렬분석
Chinese cabbage%WRKY transcription factor%genome-wide%sequence analysis
WRKY转录因子是一类重要的调控分子,在高等植物中以基因家族的形式存在.试验以大白菜基因组数据为材料,利用生物信息学手段对WRKY转录因子进行了全基因组鉴定与分析.结果表明,大白菜至少有134个WRKY转录因子,蛋白序列长度为143～1 082;基因组DNA全长880 ～9 099 bp,具1～15个内含子.染色体定位结果表明,10条染色体上均有WRKY转录因子基因的分布,A3染色体上最多(26),A10染色体分布最少(4).大白菜WRKY转录因子可分为3大类,Ⅰ类、Ⅱ类和Ⅲ类的数量分别为27,83和24,它们处于进化树的不同分支.除保守的WRKYGQK和常见变异序列WRKYGKK外,新发现WRKDGQK,WRKNGQK和WMKYGQK等3种WRKY结构域类型.
WRKY轉錄因子是一類重要的調控分子,在高等植物中以基因傢族的形式存在.試驗以大白菜基因組數據為材料,利用生物信息學手段對WRKY轉錄因子進行瞭全基因組鑒定與分析.結果錶明,大白菜至少有134箇WRKY轉錄因子,蛋白序列長度為143～1 082;基因組DNA全長880 ～9 099 bp,具1～15箇內含子.染色體定位結果錶明,10條染色體上均有WRKY轉錄因子基因的分佈,A3染色體上最多(26),A10染色體分佈最少(4).大白菜WRKY轉錄因子可分為3大類,Ⅰ類、Ⅱ類和Ⅲ類的數量分彆為27,83和24,它們處于進化樹的不同分支.除保守的WRKYGQK和常見變異序列WRKYGKK外,新髮現WRKDGQK,WRKNGQK和WMKYGQK等3種WRKY結構域類型.
WRKY전록인자시일류중요적조공분자,재고등식물중이기인가족적형식존재.시험이대백채기인조수거위재료,이용생물신식학수단대WRKY전록인자진행료전기인조감정여분석.결과표명,대백채지소유134개WRKY전록인자,단백서렬장도위143～1 082;기인조DNA전장880 ～9 099 bp,구1～15개내함자.염색체정위결과표명,10조염색체상균유WRKY전록인자기인적분포,A3염색체상최다(26),A10염색체분포최소(4).대백채WRKY전록인자가분위3대류,Ⅰ류、Ⅱ류화Ⅲ류적수량분별위27,83화24,타문처우진화수적불동분지.제보수적WRKYGQK화상견변이서렬WRKYGKK외,신발현WRKDGQK,WRKNGQK화WMKYGQK등3충WRKY결구역류형.
