林业科学
林業科學
임업과학
SCIENTIA SILVAE SINICAE
2013年
11期
77-82
,共6页
牛苏燕%范国强%赵振利%邓敏捷%董焱鹏
牛囌燕%範國彊%趙振利%鄧敏捷%董焱鵬
우소연%범국강%조진리%산민첩%동염붕
泡桐%microRNA%高通量测序%功能分析
泡桐%microRNA%高通量測序%功能分析
포동%microRNA%고통량측서%공능분석
Paulownia%microRNA%high throughput sequencing%functional analysis
以不同种(品种)泡桐叶片为材料,利用第二代高通量测序技术和生物信息学方法构建泡桐小RNA(sRNA)文库,并对其microRNA (miRNA)靶基因功能进行分析.结果表明:在得到的87 066 707条高质量reads 中,能与泡桐转录组完全匹配的有41 399 208条,占高质量序列的47.55％.sRNA长度主要分布在20 ～ 25 nt之间,其中,长度为24 nt的数量最多,其次为21 nt的sRNA.鉴定出的44个保守miRNA分属于14个不同miRNA家族,并且不同miRNA家族的miRNA成员数量也存在差异.对鉴定出的27个新miRNA进行靶基因预测及功能分析,结果为阐明miRNAs在泡桐生长发育过程中的作用奠定基础.
以不同種(品種)泡桐葉片為材料,利用第二代高通量測序技術和生物信息學方法構建泡桐小RNA(sRNA)文庫,併對其microRNA (miRNA)靶基因功能進行分析.結果錶明:在得到的87 066 707條高質量reads 中,能與泡桐轉錄組完全匹配的有41 399 208條,佔高質量序列的47.55％.sRNA長度主要分佈在20 ～ 25 nt之間,其中,長度為24 nt的數量最多,其次為21 nt的sRNA.鑒定齣的44箇保守miRNA分屬于14箇不同miRNA傢族,併且不同miRNA傢族的miRNA成員數量也存在差異.對鑒定齣的27箇新miRNA進行靶基因預測及功能分析,結果為闡明miRNAs在泡桐生長髮育過程中的作用奠定基礎.
이불동충(품충)포동협편위재료,이용제이대고통량측서기술화생물신식학방법구건포동소RNA(sRNA)문고,병대기microRNA (miRNA)파기인공능진행분석.결과표명:재득도적87 066 707조고질량reads 중,능여포동전록조완전필배적유41 399 208조,점고질량서렬적47.55％.sRNA장도주요분포재20 ～ 25 nt지간,기중,장도위24 nt적수량최다,기차위21 nt적sRNA.감정출적44개보수miRNA분속우14개불동miRNA가족,병차불동miRNA가족적miRNA성원수량야존재차이.대감정출적27개신miRNA진행파기인예측급공능분석,결과위천명miRNAs재포동생장발육과정중적작용전정기출.
