生物学杂志
生物學雜誌
생물학잡지
JOURNAL OF BIOLOGY
2013年
1期
9-13
,共5页
HIV-1%Gp120%高变区%长度多态性%糖基化位点%序列特征
HIV-1%Gp120%高變區%長度多態性%糖基化位點%序列特徵
HIV-1%Gp120%고변구%장도다태성%당기화위점%서렬특정
HIV-1 Gp120及其5个高变区的多态性是HIV-1能够逃逸宿主免疫反应和耐药性的主要原因.下载了现有数据库中记载的包括B '、C、CRF01_AE、CRF07_BC和CRF08_BC 5种亚洲主要流行亚型和重组型的所有Gp120及其5个高变区序列,分析了HIV-1Gp120及其5个高变区序列的长度多态性,糖基化位点数以及序列特征.结果显示,绝大部分的HIV-1Gp120序列长度为496 ~515个氨基酸之间,这提示Gp120长度为496~515个氨基酸的HIV-1毒株可能是疫苗研究的理想毒株.比较5个高变区,V3区表现出了最低的长度多态性,几乎没有糖基化位点,表明受到较强的功能限制.不同亚型和重组型的V3区一致序列比较发现,所有的HIV-1亚型均表现为R5型.这提示阻断HIV-1病毒结合CCR5受体是治疗艾滋病的有效途径,R5型毒株可以作为艾滋病疫苗研究的理想毒株.另外,V1和V4区展现了很高的长度多态性,糖基化位点也较多;而V2和V5区的长度多态性和糖基化位点都较低.这些结果表明降低这4个高变区的多态性和糖基化位点数目可能解决HIV-1病毒对疫苗的逃逸,从而研究出真正有效的疫苗.
HIV-1 Gp120及其5箇高變區的多態性是HIV-1能夠逃逸宿主免疫反應和耐藥性的主要原因.下載瞭現有數據庫中記載的包括B '、C、CRF01_AE、CRF07_BC和CRF08_BC 5種亞洲主要流行亞型和重組型的所有Gp120及其5箇高變區序列,分析瞭HIV-1Gp120及其5箇高變區序列的長度多態性,糖基化位點數以及序列特徵.結果顯示,絕大部分的HIV-1Gp120序列長度為496 ~515箇氨基痠之間,這提示Gp120長度為496~515箇氨基痠的HIV-1毒株可能是疫苗研究的理想毒株.比較5箇高變區,V3區錶現齣瞭最低的長度多態性,幾乎沒有糖基化位點,錶明受到較彊的功能限製.不同亞型和重組型的V3區一緻序列比較髮現,所有的HIV-1亞型均錶現為R5型.這提示阻斷HIV-1病毒結閤CCR5受體是治療艾滋病的有效途徑,R5型毒株可以作為艾滋病疫苗研究的理想毒株.另外,V1和V4區展現瞭很高的長度多態性,糖基化位點也較多;而V2和V5區的長度多態性和糖基化位點都較低.這些結果錶明降低這4箇高變區的多態性和糖基化位點數目可能解決HIV-1病毒對疫苗的逃逸,從而研究齣真正有效的疫苗.
HIV-1 Gp120급기5개고변구적다태성시HIV-1능구도일숙주면역반응화내약성적주요원인.하재료현유수거고중기재적포괄B '、C、CRF01_AE、CRF07_BC화CRF08_BC 5충아주주요류행아형화중조형적소유Gp120급기5개고변구서렬,분석료HIV-1Gp120급기5개고변구서렬적장도다태성,당기화위점수이급서렬특정.결과현시,절대부분적HIV-1Gp120서렬장도위496 ~515개안기산지간,저제시Gp120장도위496~515개안기산적HIV-1독주가능시역묘연구적이상독주.비교5개고변구,V3구표현출료최저적장도다태성,궤호몰유당기화위점,표명수도교강적공능한제.불동아형화중조형적V3구일치서렬비교발현,소유적HIV-1아형균표현위R5형.저제시조단HIV-1병독결합CCR5수체시치료애자병적유효도경,R5형독주가이작위애자병역묘연구적이상독주.령외,V1화V4구전현료흔고적장도다태성,당기화위점야교다;이V2화V5구적장도다태성화당기화위점도교저.저사결과표명강저저4개고변구적다태성화당기화위점수목가능해결HIV-1병독대역묘적도일,종이연구출진정유효적역묘.