四川动物
四川動物
사천동물
SICHUAN JOURNAL OF ZOOLOGY
2013年
1期
51-59
,共9页
宋兴超%刘汇涛%岳志刚%杨颖%邢秀梅%杨福合
宋興超%劉彙濤%嶽誌剛%楊穎%邢秀梅%楊福閤
송흥초%류회도%악지강%양영%형수매%양복합
甘肃马鹿%肌细胞生成素%基岗克隆%生物信息学%结构特征%系统进化树
甘肅馬鹿%肌細胞生成素%基崗剋隆%生物信息學%結構特徵%繫統進化樹
감숙마록%기세포생성소%기강극륭%생물신식학%결구특정%계통진화수
根据GenBank中公布的绵羊、水牛、猪、小鼠及人的肌细胞生成素基因(myogenin) DNA序列,设计了3对引物,采用PCR扩增和克隆技术,首次从甘肃马鹿血液基因组中获得了myogenin基因序列,并利用生物信息学方法对甘肃马鹿该基因核苷酸及其编码氨基酸序列的结构特征进行初步预测和分析,进一步基于该基因氨基酸序列构建了15个物种的分子系统进化树.结果表明,获得的甘肃马鹿myogenin基因序列大小为3168 bp(GenBank登录号:FJ746497),包括3个外显子、2个内含子、部分5'UTR和3'UTR,其序列包括1个684 bp的开放阅读框,编码227个氨基酸,myogenin蛋白理论分子质量为25.2493 kDa,PI为5.68,不稳定系数是66.22,属于酸性不稳定蛋白质.进一步分析发现,该序列不含有信号肽和跨膜区域,含有11个广泛磷酸化位点,第1~ 136个氨基酸为甘肃马鹿myogenin基因bHLH保守结构功能域,二级结构以无规则卷曲和α-螺旋为主.序列相似性及分子系统进化分析显示,甘肃马鹿myogenin基因与反刍动物山羊、绵羊和水牛的亲缘关系最近.甘肃马鹿myogenin基因的克隆及序列结构特征的生物信息学预测为进一步探讨鹿科动物肌肉生长发育的分子调控机理奠定了理论基础.
根據GenBank中公佈的綿羊、水牛、豬、小鼠及人的肌細胞生成素基因(myogenin) DNA序列,設計瞭3對引物,採用PCR擴增和剋隆技術,首次從甘肅馬鹿血液基因組中穫得瞭myogenin基因序列,併利用生物信息學方法對甘肅馬鹿該基因覈苷痠及其編碼氨基痠序列的結構特徵進行初步預測和分析,進一步基于該基因氨基痠序列構建瞭15箇物種的分子繫統進化樹.結果錶明,穫得的甘肅馬鹿myogenin基因序列大小為3168 bp(GenBank登錄號:FJ746497),包括3箇外顯子、2箇內含子、部分5'UTR和3'UTR,其序列包括1箇684 bp的開放閱讀框,編碼227箇氨基痠,myogenin蛋白理論分子質量為25.2493 kDa,PI為5.68,不穩定繫數是66.22,屬于痠性不穩定蛋白質.進一步分析髮現,該序列不含有信號肽和跨膜區域,含有11箇廣汎燐痠化位點,第1~ 136箇氨基痠為甘肅馬鹿myogenin基因bHLH保守結構功能域,二級結構以無規則捲麯和α-螺鏇為主.序列相似性及分子繫統進化分析顯示,甘肅馬鹿myogenin基因與反芻動物山羊、綿羊和水牛的親緣關繫最近.甘肅馬鹿myogenin基因的剋隆及序列結構特徵的生物信息學預測為進一步探討鹿科動物肌肉生長髮育的分子調控機理奠定瞭理論基礎.
근거GenBank중공포적면양、수우、저、소서급인적기세포생성소기인(myogenin) DNA서렬,설계료3대인물,채용PCR확증화극륭기술,수차종감숙마록혈액기인조중획득료myogenin기인서렬,병이용생물신식학방법대감숙마록해기인핵감산급기편마안기산서렬적결구특정진행초보예측화분석,진일보기우해기인안기산서렬구건료15개물충적분자계통진화수.결과표명,획득적감숙마록myogenin기인서렬대소위3168 bp(GenBank등록호:FJ746497),포괄3개외현자、2개내함자、부분5'UTR화3'UTR,기서렬포괄1개684 bp적개방열독광,편마227개안기산,myogenin단백이론분자질량위25.2493 kDa,PI위5.68,불은정계수시66.22,속우산성불은정단백질.진일보분석발현,해서렬불함유신호태화과막구역,함유11개엄범린산화위점,제1~ 136개안기산위감숙마록myogenin기인bHLH보수결구공능역,이급결구이무규칙권곡화α-라선위주.서렬상사성급분자계통진화분석현시,감숙마록myogenin기인여반추동물산양、면양화수우적친연관계최근.감숙마록myogenin기인적극륭급서렬결구특정적생물신식학예측위진일보탐토록과동물기육생장발육적분자조공궤리전정료이론기출.