湖南林业科技
湖南林業科技
호남임업과기
HUNAN FORESTRY SCIENCE & TECHNOLOGY
2013年
1期
14-17,64
,共5页
松属%马尾松%EST%SSR
鬆屬%馬尾鬆%EST%SSR
송속%마미송%EST%SSR
利用松属5个树种的EST序列,分别树种查找SSR位点,采用Primer3.0软件进行引物设计.设计的5个树种的EST-SSR引物中:所占比例最高的均为三核苷酸重复,其次是六核苷酸重复,两者之和都达到了64%以上;四核苷酸重复所占比例均为最低.从设计的引物中分别不同树种各选取20对进行引物合成和通用性检测以及马尾松群体检测,结果表明:松属5个树种的EST序列开发的马尾松SSR引物,其在马尾松中的扩增成功率为60%~80%;最高的是辐射松,最低的是海岸松,平均为72%.通用性最好的为辐射松,属内的通用性为94%;属间和科间通用性也分别达到75%和44%.不同树种序列来源的EST-SSR引物,其扩增成功率在10%~30%;最高的是北美短叶松,其次是辐射松,最低的是扭叶松和火炬松;平均为17%.
利用鬆屬5箇樹種的EST序列,分彆樹種查找SSR位點,採用Primer3.0軟件進行引物設計.設計的5箇樹種的EST-SSR引物中:所佔比例最高的均為三覈苷痠重複,其次是六覈苷痠重複,兩者之和都達到瞭64%以上;四覈苷痠重複所佔比例均為最低.從設計的引物中分彆不同樹種各選取20對進行引物閤成和通用性檢測以及馬尾鬆群體檢測,結果錶明:鬆屬5箇樹種的EST序列開髮的馬尾鬆SSR引物,其在馬尾鬆中的擴增成功率為60%~80%;最高的是輻射鬆,最低的是海岸鬆,平均為72%.通用性最好的為輻射鬆,屬內的通用性為94%;屬間和科間通用性也分彆達到75%和44%.不同樹種序列來源的EST-SSR引物,其擴增成功率在10%~30%;最高的是北美短葉鬆,其次是輻射鬆,最低的是扭葉鬆和火炬鬆;平均為17%.
이용송속5개수충적EST서렬,분별수충사조SSR위점,채용Primer3.0연건진행인물설계.설계적5개수충적EST-SSR인물중:소점비례최고적균위삼핵감산중복,기차시륙핵감산중복,량자지화도체도료64%이상;사핵감산중복소점비례균위최저.종설계적인물중분별불동수충각선취20대진행인물합성화통용성검측이급마미송군체검측,결과표명:송속5개수충적EST서렬개발적마미송SSR인물,기재마미송중적확증성공솔위60%~80%;최고적시복사송,최저적시해안송,평균위72%.통용성최호적위복사송,속내적통용성위94%;속간화과간통용성야분별체도75%화44%.불동수충서렬래원적EST-SSR인물,기확증성공솔재10%~30%;최고적시북미단협송,기차시복사송,최저적시뉴협송화화거송;평균위17%.