农业生物技术学报
農業生物技術學報
농업생물기술학보
JOURNAL OF AGRICULTURAL BIOTECHNOLOGY
2014年
6期
703-711
,共9页
刘姗%孙蓉%唐自钟%郑天润%高静雷%陈惠%李成磊
劉姍%孫蓉%唐自鐘%鄭天潤%高靜雷%陳惠%李成磊
류산%손용%당자종%정천윤%고정뢰%진혜%리성뢰
金龙胆草%查尔酮合酶(CHS)%克隆%生物信息学分析%表达量分析
金龍膽草%查爾酮閤酶(CHS)%剋隆%生物信息學分析%錶達量分析
금룡담초%사이동합매(CHS)%극륭%생물신식학분석%표체량분석
Conyza blinii Lévl.%Chalcone synthase%Clone%Bioinformatic analysis%Expression analysis
查尔酮合酶(chalcone synthase,CHS)是植物类黄酮化合物合成的第一关键酶.为了获得金龙胆草(Conyza blinii Lévl.)CHS基因,本研究采用快速扩增cDNA末端(rapid-amplification of cDNA ends,RACE)技术克隆得到了金龙胆草CHS基因的DNA和cDNA全长序列,并进行生物信息学分析,通过RTPCR检测该基因在花期不同组织部位中的表达情况并检测对应部位的相对花青素含量.结果表明,获得的CHS基因DNA全长2 098 bp,包括2个内含子;cDNA全长为1 692 bp,含有完整开放阅读框(1 197 bp),编码399个氨基酸,包含查尔酮合酶的标志性序列,命名为CbCHS(GenBank登录号:KJ155749).序列比对结果显示,金龙胆草CbCHS基因与已报道的其它植物的CHS氨基酸序列具有很高相似性(最高为95％).半定量RT-PCR结果显示,在叶和茎的表达量最高,相对表达量分别达到87.03％和98.33％,表达量之间没有显著差异(P＞0.05);在根中CbCHS基因表达量最少,相对表达量仅为9.43％,表达量与其余部位具有显著差异(P＜0.05).花青素含量也以茎和叶中最高,根中微量,表明CbCHS基因与花青素的蓄积有一定相关性.本研究首次克隆了金龙胆草CbCHS基因的全长DNA及cDNA序列,研究了其在花期不同组织器官中的表达量差异及与花青素的含量关系,为进一步研究CbCHS基因对金龙胆草黄酮含量的影响及其调控机制提供了基础资料.
查爾酮閤酶(chalcone synthase,CHS)是植物類黃酮化閤物閤成的第一關鍵酶.為瞭穫得金龍膽草(Conyza blinii Lévl.)CHS基因,本研究採用快速擴增cDNA末耑(rapid-amplification of cDNA ends,RACE)技術剋隆得到瞭金龍膽草CHS基因的DNA和cDNA全長序列,併進行生物信息學分析,通過RTPCR檢測該基因在花期不同組織部位中的錶達情況併檢測對應部位的相對花青素含量.結果錶明,穫得的CHS基因DNA全長2 098 bp,包括2箇內含子;cDNA全長為1 692 bp,含有完整開放閱讀框(1 197 bp),編碼399箇氨基痠,包含查爾酮閤酶的標誌性序列,命名為CbCHS(GenBank登錄號:KJ155749).序列比對結果顯示,金龍膽草CbCHS基因與已報道的其它植物的CHS氨基痠序列具有很高相似性(最高為95％).半定量RT-PCR結果顯示,在葉和莖的錶達量最高,相對錶達量分彆達到87.03％和98.33％,錶達量之間沒有顯著差異(P＞0.05);在根中CbCHS基因錶達量最少,相對錶達量僅為9.43％,錶達量與其餘部位具有顯著差異(P＜0.05).花青素含量也以莖和葉中最高,根中微量,錶明CbCHS基因與花青素的蓄積有一定相關性.本研究首次剋隆瞭金龍膽草CbCHS基因的全長DNA及cDNA序列,研究瞭其在花期不同組織器官中的錶達量差異及與花青素的含量關繫,為進一步研究CbCHS基因對金龍膽草黃酮含量的影響及其調控機製提供瞭基礎資料.
사이동합매(chalcone synthase,CHS)시식물류황동화합물합성적제일관건매.위료획득금룡담초(Conyza blinii Lévl.)CHS기인,본연구채용쾌속확증cDNA말단(rapid-amplification of cDNA ends,RACE)기술극륭득도료금룡담초CHS기인적DNA화cDNA전장서렬,병진행생물신식학분석,통과RTPCR검측해기인재화기불동조직부위중적표체정황병검측대응부위적상대화청소함량.결과표명,획득적CHS기인DNA전장2 098 bp,포괄2개내함자;cDNA전장위1 692 bp,함유완정개방열독광(1 197 bp),편마399개안기산,포함사이동합매적표지성서렬,명명위CbCHS(GenBank등록호:KJ155749).서렬비대결과현시,금룡담초CbCHS기인여이보도적기타식물적CHS안기산서렬구유흔고상사성(최고위95％).반정량RT-PCR결과현시,재협화경적표체량최고,상대표체량분별체도87.03％화98.33％,표체량지간몰유현저차이(P＞0.05);재근중CbCHS기인표체량최소,상대표체량부위9.43％,표체량여기여부위구유현저차이(P＜0.05).화청소함량야이경화협중최고,근중미량,표명CbCHS기인여화청소적축적유일정상관성.본연구수차극륭료금룡담초CbCHS기인적전장DNA급cDNA서렬,연구료기재화기불동조직기관중적표체량차이급여화청소적함량관계,위진일보연구CbCHS기인대금룡담초황동함량적영향급기조공궤제제공료기출자료.
