辽宁大学学报(自然科学版)
遼寧大學學報(自然科學版)
료녕대학학보(자연과학판)
JOURNAL OF LIAONING UNIVERSITY(NATURAL SCIENCE EDITION)
2013年
4期
345-355
,共11页
霍雅鹏%万冬梅%张宇婷%曹君
霍雅鵬%萬鼕梅%張宇婷%曹君
곽아붕%만동매%장우정%조군
杂色山雀%遗传多样性%Cytb基因%单倍型
雜色山雀%遺傳多樣性%Cytb基因%單倍型
잡색산작%유전다양성%Cytb기인%단배형
杂色山雀(P arus varius)为东亚特有鸟类、分布呈片段化.为了深入了解杂色山雀中国大陆各地理种群遗传水平现状,分析了杂色山雀8个地方种群49个样本的线粒体Cytb基因全序列(1143bp)和部分ND5基因序列(957 bp),所测样品全长共2.1 kb.结果显示:T、C、A、G碱基的平均含量分别为21.5%、37.4%、28.9%、12.2%,A+T含量(50.4%)略高于G+C含量(49.6%);发现17个变异位点,其中单变异位点为7个,简约信息位点数为10个;检测到14个单倍型,8个地方种群共享一个单倍型(Hap-1),说明这个单倍型是个较古老的单倍型,也反映了这几个群体间的分化是不显著的.5个种群的单倍型多样性为0.822 39,核苷酸多样性为0.000 82,平均核苷酸差异数为4.663 83,总体上看,杂色山雀具有较低的单倍型多样性和核苷酸多样性.五个种群的Nm值为5.282 21~17.33645,Fst值为0.002 07~0.086 47,构建的系统发生树和TCS网络图进一步分析表明杂色山雀遗传多样性较低、基因交流非常频繁、种群间的分化不显著.中性检验显示偏离中性期望值,表明种群在进化的过程中出现过群体急速扩张事件.
雜色山雀(P arus varius)為東亞特有鳥類、分佈呈片段化.為瞭深入瞭解雜色山雀中國大陸各地理種群遺傳水平現狀,分析瞭雜色山雀8箇地方種群49箇樣本的線粒體Cytb基因全序列(1143bp)和部分ND5基因序列(957 bp),所測樣品全長共2.1 kb.結果顯示:T、C、A、G堿基的平均含量分彆為21.5%、37.4%、28.9%、12.2%,A+T含量(50.4%)略高于G+C含量(49.6%);髮現17箇變異位點,其中單變異位點為7箇,簡約信息位點數為10箇;檢測到14箇單倍型,8箇地方種群共享一箇單倍型(Hap-1),說明這箇單倍型是箇較古老的單倍型,也反映瞭這幾箇群體間的分化是不顯著的.5箇種群的單倍型多樣性為0.822 39,覈苷痠多樣性為0.000 82,平均覈苷痠差異數為4.663 83,總體上看,雜色山雀具有較低的單倍型多樣性和覈苷痠多樣性.五箇種群的Nm值為5.282 21~17.33645,Fst值為0.002 07~0.086 47,構建的繫統髮生樹和TCS網絡圖進一步分析錶明雜色山雀遺傳多樣性較低、基因交流非常頻繁、種群間的分化不顯著.中性檢驗顯示偏離中性期望值,錶明種群在進化的過程中齣現過群體急速擴張事件.
잡색산작(P arus varius)위동아특유조류、분포정편단화.위료심입료해잡색산작중국대륙각지리충군유전수평현상,분석료잡색산작8개지방충군49개양본적선립체Cytb기인전서렬(1143bp)화부분ND5기인서렬(957 bp),소측양품전장공2.1 kb.결과현시:T、C、A、G감기적평균함량분별위21.5%、37.4%、28.9%、12.2%,A+T함량(50.4%)략고우G+C함량(49.6%);발현17개변이위점,기중단변이위점위7개,간약신식위점수위10개;검측도14개단배형,8개지방충군공향일개단배형(Hap-1),설명저개단배형시개교고로적단배형,야반영료저궤개군체간적분화시불현저적.5개충군적단배형다양성위0.822 39,핵감산다양성위0.000 82,평균핵감산차이수위4.663 83,총체상간,잡색산작구유교저적단배형다양성화핵감산다양성.오개충군적Nm치위5.282 21~17.33645,Fst치위0.002 07~0.086 47,구건적계통발생수화TCS망락도진일보분석표명잡색산작유전다양성교저、기인교류비상빈번、충군간적분화불현저.중성검험현시편리중성기망치,표명충군재진화적과정중출현과군체급속확장사건.