化工学报
化工學報
화공학보
JOURNAL OF CHEMICAL INDUSY AND ENGINEERING (CHINA)
2013年
12期
4662-4666
,共5页
高斯混合模型%核函数%最小二乘支持向量机%脱氧核糖核酸%模型简化%算法
高斯混閤模型%覈函數%最小二乘支持嚮量機%脫氧覈糖覈痠%模型簡化%算法
고사혼합모형%핵함수%최소이승지지향량궤%탈양핵당핵산%모형간화%산법
Gaussian mixture model%kernel function%least square support vector machine%DNA%model reduction%algorithm
由于真核启动子DNA序列结构复杂、数据量巨大,启动子序列辨识一直是一个难点.首先对真核启动子序列寡核苷酸位置分布特征进行高斯混合模型建模,能够将出现频率少但重要的基序提取出来.并将高斯混合模型作为真核启动子最小二乘支持向量机分类器中的核函数,将最小二乘支持向量机模型简化为最小二乘模型,计算量减少.辨识结果表明,该算法的辨识精度优于贝叶斯辨识算法,和RBF核LS-SVM相比,辨识精度基本相同,建模时间略有缩短.
由于真覈啟動子DNA序列結構複雜、數據量巨大,啟動子序列辨識一直是一箇難點.首先對真覈啟動子序列寡覈苷痠位置分佈特徵進行高斯混閤模型建模,能夠將齣現頻率少但重要的基序提取齣來.併將高斯混閤模型作為真覈啟動子最小二乘支持嚮量機分類器中的覈函數,將最小二乘支持嚮量機模型簡化為最小二乘模型,計算量減少.辨識結果錶明,該算法的辨識精度優于貝葉斯辨識算法,和RBF覈LS-SVM相比,辨識精度基本相同,建模時間略有縮短.
유우진핵계동자DNA서렬결구복잡、수거량거대,계동자서렬변식일직시일개난점.수선대진핵계동자서렬과핵감산위치분포특정진행고사혼합모형건모,능구장출현빈솔소단중요적기서제취출래.병장고사혼합모형작위진핵계동자최소이승지지향량궤분류기중적핵함수,장최소이승지지향량궤모형간화위최소이승모형,계산량감소.변식결과표명,해산법적변식정도우우패협사변식산법,화RBF핵LS-SVM상비,변식정도기본상동,건모시간략유축단.
