浙江大学学报(农业与生命科学版)
浙江大學學報(農業與生命科學版)
절강대학학보(농업여생명과학판)
JOURNAL OF ZHEJIANG UNIVERSITY(AGRICULTURE & LIFE SCIENCES)
2012年
6期
655-661
,共7页
高玉龙%桂毅杰%肖炳光%薄世平%严广号%樊龙江
高玉龍%桂毅傑%肖炳光%薄世平%嚴廣號%樊龍江
고옥룡%계의걸%초병광%박세평%엄엄호%번룡강
烟草%微型反向重复转座元件(MITE)%MITE位点间多态性(IMP)%分子标记%遗传图谱
煙草%微型反嚮重複轉座元件(MITE)%MITE位點間多態性(IMP)%分子標記%遺傳圖譜
연초%미형반향중복전좌원건(MITE)%MITE위점간다태성(IMP)%분자표기%유전도보
为在烟草(Nicotiana tabacum)上进行IMP (inter-MITE polymorphism,MITE位点间多态性)标记开发,利用美国烟草基因组测序数据和MITE (miniature inverted repeat transposable element,微型反向重复转座元件)结构特征,通过生物信息学方法获得11 581组具有特异TIR (terminal inverted repeat,末端重复元件)序列的MITE及其多序列联配结果,并根据联配结果设计219条烟草IMP引物;利用9个不同类型烟草代表性品种进行测试,其中119条引物PCR扩增成功,引物开发成功率为54.6%;进一步对一个烤烟遗传群体亲本‘红花大金元’和‘Hicks Broadleaf'进行标记筛选,共获得29个多态性标记,群体检测表明有21个标记可以整合定位到一个SSR标记遗传连锁图上.说明IMP标记在烟草中是一种可以利用的分子标记,但跟其他标记一样表现出较低的多态性,需高通量检测平台与之配套来提高其开发效率.
為在煙草(Nicotiana tabacum)上進行IMP (inter-MITE polymorphism,MITE位點間多態性)標記開髮,利用美國煙草基因組測序數據和MITE (miniature inverted repeat transposable element,微型反嚮重複轉座元件)結構特徵,通過生物信息學方法穫得11 581組具有特異TIR (terminal inverted repeat,末耑重複元件)序列的MITE及其多序列聯配結果,併根據聯配結果設計219條煙草IMP引物;利用9箇不同類型煙草代錶性品種進行測試,其中119條引物PCR擴增成功,引物開髮成功率為54.6%;進一步對一箇烤煙遺傳群體親本‘紅花大金元’和‘Hicks Broadleaf'進行標記篩選,共穫得29箇多態性標記,群體檢測錶明有21箇標記可以整閤定位到一箇SSR標記遺傳連鎖圖上.說明IMP標記在煙草中是一種可以利用的分子標記,但跟其他標記一樣錶現齣較低的多態性,需高通量檢測平檯與之配套來提高其開髮效率.
위재연초(Nicotiana tabacum)상진행IMP (inter-MITE polymorphism,MITE위점간다태성)표기개발,이용미국연초기인조측서수거화MITE (miniature inverted repeat transposable element,미형반향중복전좌원건)결구특정,통과생물신식학방법획득11 581조구유특이TIR (terminal inverted repeat,말단중복원건)서렬적MITE급기다서렬련배결과,병근거련배결과설계219조연초IMP인물;이용9개불동류형연초대표성품충진행측시,기중119조인물PCR확증성공,인물개발성공솔위54.6%;진일보대일개고연유전군체친본‘홍화대금원’화‘Hicks Broadleaf'진행표기사선,공획득29개다태성표기,군체검측표명유21개표기가이정합정위도일개SSR표기유전련쇄도상.설명IMP표기재연초중시일충가이이용적분자표기,단근기타표기일양표현출교저적다태성,수고통량검측평태여지배투래제고기개발효솔.