大连海洋大学学报
大連海洋大學學報
대련해양대학학보
JOURNAL OF DALIAN FISHERIES UNIVERSITY
2013年
5期
431-437
,共7页
王琳楠%闫喜武%秦艳杰%聂鸿涛%牛泓博%张国范
王琳楠%閆喜武%秦豔傑%聶鴻濤%牛泓博%張國範
왕림남%염희무%진염걸%섭홍도%우홍박%장국범
帘蛤目%COI基因%系统发育%分类鉴定%DNA条形码
簾蛤目%COI基因%繫統髮育%分類鑒定%DNA條形碼
렴합목%COI기인%계통발육%분류감정%DNA조형마
Veneroida%COI gene%phylogeny%taxonomy%DNA barcoding
对中国帘蛤目主要经济贝类的分子系统发育进行了研究,应用DNA条形码通用引物扩增了6种中国近海帘蛤目经济贝类共计60个个体的COI基因片段,与GenBank收录的10种帘蛤目贝类50条同源序列进行比对.结果表明:帘蛤目贝类COI基因存在碱基插入和缺失现象,在16个物种中有6个物种存在103个插入和缺失位点,其中杂色蛤仔Ruditapes variegata、裂纹哥特蛤Katelysia hiantina插入和缺失位点均为30个,大竹蛏Solen grandis为27个;碱基的组成出现偏倚现象,A+T含量(64.2%)明显高于G+C含量(35.8%);基于K2P模型的计算,16个物种的种内平均遗传距离为0.010 6,种间平均遗传距离为0.388 4,后者是前者的21.34倍;系统发育树聚类分析表明,COI基因在科、属、种水平上的鉴定及其系统进化关系重构方面与传统的形态学分类一致性较高.研究表明,线粒体COI基因作为帘蛤目贝类DNA条形码在物种鉴定的适用性上提供了一定的依据,同时也为形态分类系统提供了必要补充.
對中國簾蛤目主要經濟貝類的分子繫統髮育進行瞭研究,應用DNA條形碼通用引物擴增瞭6種中國近海簾蛤目經濟貝類共計60箇箇體的COI基因片段,與GenBank收錄的10種簾蛤目貝類50條同源序列進行比對.結果錶明:簾蛤目貝類COI基因存在堿基插入和缺失現象,在16箇物種中有6箇物種存在103箇插入和缺失位點,其中雜色蛤仔Ruditapes variegata、裂紋哥特蛤Katelysia hiantina插入和缺失位點均為30箇,大竹蟶Solen grandis為27箇;堿基的組成齣現偏倚現象,A+T含量(64.2%)明顯高于G+C含量(35.8%);基于K2P模型的計算,16箇物種的種內平均遺傳距離為0.010 6,種間平均遺傳距離為0.388 4,後者是前者的21.34倍;繫統髮育樹聚類分析錶明,COI基因在科、屬、種水平上的鑒定及其繫統進化關繫重構方麵與傳統的形態學分類一緻性較高.研究錶明,線粒體COI基因作為簾蛤目貝類DNA條形碼在物種鑒定的適用性上提供瞭一定的依據,同時也為形態分類繫統提供瞭必要補充.
대중국렴합목주요경제패류적분자계통발육진행료연구,응용DNA조형마통용인물확증료6충중국근해렴합목경제패류공계60개개체적COI기인편단,여GenBank수록적10충렴합목패류50조동원서렬진행비대.결과표명:렴합목패류COI기인존재감기삽입화결실현상,재16개물충중유6개물충존재103개삽입화결실위점,기중잡색합자Ruditapes variegata、렬문가특합Katelysia hiantina삽입화결실위점균위30개,대죽정Solen grandis위27개;감기적조성출현편의현상,A+T함량(64.2%)명현고우G+C함량(35.8%);기우K2P모형적계산,16개물충적충내평균유전거리위0.010 6,충간평균유전거리위0.388 4,후자시전자적21.34배;계통발육수취류분석표명,COI기인재과、속、충수평상적감정급기계통진화관계중구방면여전통적형태학분류일치성교고.연구표명,선립체COI기인작위렴합목패류DNA조형마재물충감정적괄용성상제공료일정적의거,동시야위형태분류계통제공료필요보충.