南京邮电大学学报（自然科学版）
南京郵電大學學報（自然科學版）
남경유전대학학보（자연과학판）
JOURNAL OF NANJING UNIVERSITY OF POSTS AND TELECOMMUNICATIONS(NATURAL SCIENCE)
2014年
2期
122-126,132
,共6页
李小慧%王凯%吴建盛%汤丽华
李小慧%王凱%吳建盛%湯麗華
리소혜%왕개%오건성%탕려화
mir-430%基因簇%生物信息学预测%分子进化
mir-430%基因簇%生物信息學預測%分子進化
mir-430%기인족%생물신식학예측%분자진화
miR-430%gene cluster%bioinformatic prediction%molecular evolution
很多microRNA (miRNA)基因在基因组上紧密排列形成miRNA基因簇,mir-430是目前已发现的最大miR-NA基因簇,但其起源和进化方面却是未知的.为了揭示mir-430基因簇的起源及其在相关物种的进化关系,文中基于miRNA序列同源保守的特点,采用BLAST程序在NCBI基因数据库中搜索mir-430序列,在14个物种中共搜索到35个mir-430基因序列,这14个物种都为硬骨鱼类.多序列对比发现mir-430基因簇成熟序列的第2到第8位碱基以及第16到第22位碱基为保守序列.进化分析表明七鳃鳗的pma-mir-430基因可能是此基因家族最早出现的基因形式,并且pma-mir-430e可能是其他物种mir-430基因的祖先基因.祖先基因经过个别碱基的缺失及突变、串联重复和大片段重复等方式形成了mir-430基因簇.该研究通过分析不同物种中mir-430基因簇的特征,揭示mir-430基因簇的分子进化规律,为其调控网络和功能研究提供理论基础.
很多microRNA (miRNA)基因在基因組上緊密排列形成miRNA基因簇,mir-430是目前已髮現的最大miR-NA基因簇,但其起源和進化方麵卻是未知的.為瞭揭示mir-430基因簇的起源及其在相關物種的進化關繫,文中基于miRNA序列同源保守的特點,採用BLAST程序在NCBI基因數據庫中搜索mir-430序列,在14箇物種中共搜索到35箇mir-430基因序列,這14箇物種都為硬骨魚類.多序列對比髮現mir-430基因簇成熟序列的第2到第8位堿基以及第16到第22位堿基為保守序列.進化分析錶明七鰓鰻的pma-mir-430基因可能是此基因傢族最早齣現的基因形式,併且pma-mir-430e可能是其他物種mir-430基因的祖先基因.祖先基因經過箇彆堿基的缺失及突變、串聯重複和大片段重複等方式形成瞭mir-430基因簇.該研究通過分析不同物種中mir-430基因簇的特徵,揭示mir-430基因簇的分子進化規律,為其調控網絡和功能研究提供理論基礎.
흔다microRNA (miRNA)기인재기인조상긴밀배렬형성miRNA기인족,mir-430시목전이발현적최대miR-NA기인족,단기기원화진화방면각시미지적.위료게시mir-430기인족적기원급기재상관물충적진화관계,문중기우miRNA서렬동원보수적특점,채용BLAST정서재NCBI기인수거고중수색mir-430서렬,재14개물충중공수색도35개mir-430기인서렬,저14개물충도위경골어류.다서렬대비발현mir-430기인족성숙서렬적제2도제8위감기이급제16도제22위감기위보수서렬.진화분석표명칠새만적pma-mir-430기인가능시차기인가족최조출현적기인형식,병차pma-mir-430e가능시기타물충mir-430기인적조선기인.조선기인경과개별감기적결실급돌변、천련중복화대편단중복등방식형성료mir-430기인족.해연구통과분석불동물충중mir-430기인족적특정,게시mir-430기인족적분자진화규률,위기조공망락화공능연구제공이론기출.
