上海大学学报（自然科学版）
上海大學學報（自然科學版）
상해대학학보（자연과학판）
JOURNAL OF SHANGHAI UNIVERSITY (NATURAL SCIENCE EDITION)
2013年
1期
75-79
,共5页
庄刚%衣娜%答亮%王翼飞
莊剛%衣娜%答亮%王翼飛
장강%의나%답량%왕익비
多重时滞系统%随机模拟算法%生化反应系统%MD-Leaping算法
多重時滯繫統%隨機模擬算法%生化反應繫統%MD-Leaping算法
다중시체계통%수궤모의산법%생화반응계통%MD-Leaping산법
针对多重时滞生化反应系统,提出MD-Leaping模拟算法,该算法能快速有效地刻画封闭系统中生化反应的进程和结果.相较于D-Leaping算法,针对单时滞反应建立以反应序列为主体的四元结构体,该算法通过对多重时滞反应系统建立以不同时滞时间为主体的四元结构体,使得在每一个跳跃时间步长内可以同时模拟多个生化反应,提高了模拟速度.该算法拓展D-Leaping算法,并首次解决多重时滞生化反应系统的加速模拟问题.通过对2个具体生化反应系统的模拟表明,该算法可以广泛地应用于多重时滞生化反应系统,并且与已有的多重时滞系统非跳跃方法(multi-delay stochastic simulation algorithm,MDSSA)相比,其运行效率有显著提高.
針對多重時滯生化反應繫統,提齣MD-Leaping模擬算法,該算法能快速有效地刻畫封閉繫統中生化反應的進程和結果.相較于D-Leaping算法,針對單時滯反應建立以反應序列為主體的四元結構體,該算法通過對多重時滯反應繫統建立以不同時滯時間為主體的四元結構體,使得在每一箇跳躍時間步長內可以同時模擬多箇生化反應,提高瞭模擬速度.該算法拓展D-Leaping算法,併首次解決多重時滯生化反應繫統的加速模擬問題.通過對2箇具體生化反應繫統的模擬錶明,該算法可以廣汎地應用于多重時滯生化反應繫統,併且與已有的多重時滯繫統非跳躍方法(multi-delay stochastic simulation algorithm,MDSSA)相比,其運行效率有顯著提高.
침대다중시체생화반응계통,제출MD-Leaping모의산법,해산법능쾌속유효지각화봉폐계통중생화반응적진정화결과.상교우D-Leaping산법,침대단시체반응건립이반응서렬위주체적사원결구체,해산법통과대다중시체반응계통건립이불동시체시간위주체적사원결구체,사득재매일개도약시간보장내가이동시모의다개생화반응,제고료모의속도.해산법탁전D-Leaping산법,병수차해결다중시체생화반응계통적가속모의문제.통과대2개구체생화반응계통적모의표명,해산법가이엄범지응용우다중시체생화반응계통,병차여이유적다중시체계통비도약방법(multi-delay stochastic simulation algorithm,MDSSA)상비,기운행효솔유현저제고.
