林业科学
林業科學
임업과학
SCIENTIA SILVAE SINICAE
2014年
5期
62-69
,共8页
谷振军%章怀云%张党权%谢耀坚%何含杰%陈丽莉%彭宽%刘果%杨丹
穀振軍%章懷雲%張黨權%謝耀堅%何含傑%陳麗莉%彭寬%劉果%楊丹
곡진군%장부운%장당권%사요견%하함걸%진려리%팽관%류과%양단
桉树%木质素%CCoAOMT亚家族%基因克隆%可变剪接%生物信息学注释
桉樹%木質素%CCoAOMT亞傢族%基因剋隆%可變剪接%生物信息學註釋
안수%목질소%CCoAOMT아가족%기인극륭%가변전접%생물신식학주석
Eucalyptus%lignin%CCoAOMT subfamily%gene cloning%alternative splicing%bioinformatics annotation
通过同源克隆策略和RACE技术获得赤桉CCoAOMT亚家族2个成员的全长cDNA序列.CCMOMT1基因的全长cDNA序列为1 020 bp,其中可读框ORF长度为738 bp,5’-UTR为106 bp,3’-UTR为176 bp;CCoAOMT2基因的全长cDNA序列为1 047 bp,其中可读框ORF长度为741 bp,5’-UTR为125 bp,3’-UTR为158bp.CCMOMT1和CCoAOMT2基因都由5个外显子组成,主要的区别在于前者第1个内含子存在5’端可变剪接位点,形成2条不同长度的mRNA,一条的ORF长度为738 bp,而另一条比前者缺失了42 bp,但不影响其余氨基酸的读码框顺序.赤桉CCoAOMT1基因在茎段中可变剪接发生在5-9月间,是桉树一年中树高和直径增长最快的阶段,这个可变剪接可能与组织器官生长发育有关.蛋白质三维结构分析表明,CCoAOMT能形成正确的酶活性中心与底物结合位点.抑制CCoAOMT基因表达,降低桉树木质素对于减少制浆造纸工业污染具有重要意义.
通過同源剋隆策略和RACE技術穫得赤桉CCoAOMT亞傢族2箇成員的全長cDNA序列.CCMOMT1基因的全長cDNA序列為1 020 bp,其中可讀框ORF長度為738 bp,5’-UTR為106 bp,3’-UTR為176 bp;CCoAOMT2基因的全長cDNA序列為1 047 bp,其中可讀框ORF長度為741 bp,5’-UTR為125 bp,3’-UTR為158bp.CCMOMT1和CCoAOMT2基因都由5箇外顯子組成,主要的區彆在于前者第1箇內含子存在5’耑可變剪接位點,形成2條不同長度的mRNA,一條的ORF長度為738 bp,而另一條比前者缺失瞭42 bp,但不影響其餘氨基痠的讀碼框順序.赤桉CCoAOMT1基因在莖段中可變剪接髮生在5-9月間,是桉樹一年中樹高和直徑增長最快的階段,這箇可變剪接可能與組織器官生長髮育有關.蛋白質三維結構分析錶明,CCoAOMT能形成正確的酶活性中心與底物結閤位點.抑製CCoAOMT基因錶達,降低桉樹木質素對于減少製漿造紙工業汙染具有重要意義.
통과동원극륭책략화RACE기술획득적안CCoAOMT아가족2개성원적전장cDNA서렬.CCMOMT1기인적전장cDNA서렬위1 020 bp,기중가독광ORF장도위738 bp,5’-UTR위106 bp,3’-UTR위176 bp;CCoAOMT2기인적전장cDNA서렬위1 047 bp,기중가독광ORF장도위741 bp,5’-UTR위125 bp,3’-UTR위158bp.CCMOMT1화CCoAOMT2기인도유5개외현자조성,주요적구별재우전자제1개내함자존재5’단가변전접위점,형성2조불동장도적mRNA,일조적ORF장도위738 bp,이령일조비전자결실료42 bp,단불영향기여안기산적독마광순서.적안CCoAOMT1기인재경단중가변전접발생재5-9월간,시안수일년중수고화직경증장최쾌적계단,저개가변전접가능여조직기관생장발육유관.단백질삼유결구분석표명,CCoAOMT능형성정학적매활성중심여저물결합위점.억제CCoAOMT기인표체,강저안수목질소대우감소제장조지공업오염구유중요의의.
