中国畜牧兽医
中國畜牧獸醫
중국축목수의
CHINA ANIMAL HUSBANDRY & VETERINARY MEDICINE
2013年
1期
84
,共1页
瘤胃细菌多样性%变形梯度凝胶电泳%16S rRNA序列分析%菌群比较
瘤胃細菌多樣性%變形梯度凝膠電泳%16S rRNA序列分析%菌群比較
류위세균다양성%변형제도응효전영%16S rRNA서렬분석%균군비교
目前对于附着于瘤胃上皮的细菌群落及其功能了解较少,本研究目的是利用16S rRNA测序、PCR-DGGE和qRT-PCR方法比较分析肉牛瘤胃上皮与瘤胃内容物细菌群落的多样性差异.从6个16S rDNA(～1.4 kb)文库中随机选取2785条序列,结果表明3个瘤胃内容物文库与3个瘤胃上皮文库的细菌群落存在差异.以97％的序列相似度进行计算,结果发现瘤胃内容物菌群文库的多样性指数(4.12/4.42/4.88)比瘤胃上皮组织菌群文库的多样性指数(2.90/2.73/3.23)高.厚壁菌门和拟杆菌门分别是瘤胃上皮组织和内容物的优势菌群,纤维杆菌门、浮霉菌门和疣唯菌门仅在瘤胃内容物中存在.通过PCR-DGGE对22头阉牛瘤胃内容物和瘤胃上皮的细菌群落分析,进一步证实瘤胃上皮栖息着一类以厚壁菌为主的独特菌群,这类菌不仅具有消化饲料的作用,还有其他未知功能.
目前對于附著于瘤胃上皮的細菌群落及其功能瞭解較少,本研究目的是利用16S rRNA測序、PCR-DGGE和qRT-PCR方法比較分析肉牛瘤胃上皮與瘤胃內容物細菌群落的多樣性差異.從6箇16S rDNA(～1.4 kb)文庫中隨機選取2785條序列,結果錶明3箇瘤胃內容物文庫與3箇瘤胃上皮文庫的細菌群落存在差異.以97％的序列相似度進行計算,結果髮現瘤胃內容物菌群文庫的多樣性指數(4.12/4.42/4.88)比瘤胃上皮組織菌群文庫的多樣性指數(2.90/2.73/3.23)高.厚壁菌門和擬桿菌門分彆是瘤胃上皮組織和內容物的優勢菌群,纖維桿菌門、浮黴菌門和疣唯菌門僅在瘤胃內容物中存在.通過PCR-DGGE對22頭閹牛瘤胃內容物和瘤胃上皮的細菌群落分析,進一步證實瘤胃上皮棲息著一類以厚壁菌為主的獨特菌群,這類菌不僅具有消化飼料的作用,還有其他未知功能.
목전대우부착우류위상피적세균군락급기공능료해교소,본연구목적시이용16S rRNA측서、PCR-DGGE화qRT-PCR방법비교분석육우류위상피여류위내용물세균군락적다양성차이.종6개16S rDNA(～1.4 kb)문고중수궤선취2785조서렬,결과표명3개류위내용물문고여3개류위상피문고적세균군락존재차이.이97％적서렬상사도진행계산,결과발현류위내용물균군문고적다양성지수(4.12/4.42/4.88)비류위상피조직균군문고적다양성지수(2.90/2.73/3.23)고.후벽균문화의간균문분별시류위상피조직화내용물적우세균군,섬유간균문、부매균문화우유균문부재류위내용물중존재.통과PCR-DGGE대22두엄우류위내용물화류위상피적세균군락분석,진일보증실류위상피서식착일류이후벽균위주적독특균군,저류균불부구유소화사료적작용,환유기타미지공능.
