上海交通大学学报(农业科学版)
上海交通大學學報(農業科學版)
상해교통대학학보(농업과학판)
JOURNAL OF SHANGHAI JIAOTONG UNIVERSITY(AGRICULTURAL SCIENCE)
2013年
1期
1-7
,共7页
王名雪%陆平%许菲%潘琪芳%唐克轩%赵静雅
王名雪%陸平%許菲%潘琪芳%唐剋軒%趙靜雅
왕명설%륙평%허비%반기방%당극헌%조정아
枸杞%胆碱合成酶%磷酸乙醇胺N-甲基转移酶(PEAMT)%基因克隆%生物信息学分析
枸杞%膽堿閤成酶%燐痠乙醇胺N-甲基轉移酶(PEAMT)%基因剋隆%生物信息學分析
구기%담감합성매%린산을순알N-갑기전이매(PEAMT)%기인극륭%생물신식학분석
利用RT-PCR和RACE结合的方法,获得了枸杞磷酸乙醇胺N-甲基转移酶PEAMT基因cDNA全序列(命名为LbPEAMT).LbPEAMT cDNA全长1 863 bp,开放读码框1 497 bp,编码一个由498个氨基酸构成的多肽,理论分子量为56.53 kDa,等电点pⅠ为5.50.通过多种序列比对,该基因编码的氨基酸序列与番茄PEAMT氨基酸的相似性为93%.二级结构预测LbPEAMT蛋白由44.98%的α-螺旋、17.67%的延伸链、6.63%的β-转角和30.72%的不规则卷曲组成.LbPEAMT是一个亲水蛋白.含有2个S-腺苷甲硫氨酸依赖催化活性结构域,分别位于N端65-164 aa和C端290-392aa.每个活性区都包含有4个部分基序,分别为Ⅰ、post Ⅰ、post Ⅱ和post Ⅲ.LbPEAMT的这2个活性区在蛋白、磷脂和小分子甲基转移酶中都是相对保守的.
利用RT-PCR和RACE結閤的方法,穫得瞭枸杞燐痠乙醇胺N-甲基轉移酶PEAMT基因cDNA全序列(命名為LbPEAMT).LbPEAMT cDNA全長1 863 bp,開放讀碼框1 497 bp,編碼一箇由498箇氨基痠構成的多肽,理論分子量為56.53 kDa,等電點pⅠ為5.50.通過多種序列比對,該基因編碼的氨基痠序列與番茄PEAMT氨基痠的相似性為93%.二級結構預測LbPEAMT蛋白由44.98%的α-螺鏇、17.67%的延伸鏈、6.63%的β-轉角和30.72%的不規則捲麯組成.LbPEAMT是一箇親水蛋白.含有2箇S-腺苷甲硫氨痠依賴催化活性結構域,分彆位于N耑65-164 aa和C耑290-392aa.每箇活性區都包含有4箇部分基序,分彆為Ⅰ、post Ⅰ、post Ⅱ和post Ⅲ.LbPEAMT的這2箇活性區在蛋白、燐脂和小分子甲基轉移酶中都是相對保守的.
이용RT-PCR화RACE결합적방법,획득료구기린산을순알N-갑기전이매PEAMT기인cDNA전서렬(명명위LbPEAMT).LbPEAMT cDNA전장1 863 bp,개방독마광1 497 bp,편마일개유498개안기산구성적다태,이론분자량위56.53 kDa,등전점pⅠ위5.50.통과다충서렬비대,해기인편마적안기산서렬여번가PEAMT안기산적상사성위93%.이급결구예측LbPEAMT단백유44.98%적α-라선、17.67%적연신련、6.63%적β-전각화30.72%적불규칙권곡조성.LbPEAMT시일개친수단백.함유2개S-선감갑류안산의뢰최화활성결구역,분별위우N단65-164 aa화C단290-392aa.매개활성구도포함유4개부분기서,분별위Ⅰ、post Ⅰ、post Ⅱ화post Ⅲ.LbPEAMT적저2개활성구재단백、린지화소분자갑기전이매중도시상대보수적.