CAJ | 학술논문

根据GenBank上公布的副猪嗜血杆菌外膜蛋白OMP5基因的核苷酸序列，设计1对特异性引物，对贵州省HPS分离株OMP5基因进行扩增。结果表明所扩增的OMP5基因的长度为1116 bp，与SH0165株对应的核苷酸序列和氨基酸同源性均为100%。生物信息学分析结果表明，OMP5基因所编码的外膜蛋白P5的理论等电点pI为9.34，不稳定系数为20.44，推测其为稳定性蛋白；脂肪指数为83.94，总体平均亲水性为-0.172，推测该蛋白是一种亲水性蛋白；该蛋白含有丰富的α-螺旋、β-折叠、β-转角和无规则卷曲，无跨膜区，最前端的21个N-末端氨基酸残基为信号肽序列并且主要为疏水性氨基酸，最佳切割位点在第21～22个氨基酸之间；结构位点预测表明该蛋白含有多个不同的糖基化和磷酸化位点。
근거GenBank상공포적부저기혈간균외막단백OMP5기인적핵감산서렬，설계1대특이성인물，대귀주성HPS분리주OMP5기인진행확증。결과표명소확증적OMP5기인적장도위1116 bp，여SH0165주대응적핵감산서렬화안기산동원성균위100%。생물신식학분석결과표명，OMP5기인소편마적외막단백P5적이론등전점pI위9.34，불은정계수위20.44，추측기위은정성단백；지방지수위83.94，총체평균친수성위-0.172，추측해단백시일충친수성단백；해단백함유봉부적α-라선、β-절첩、β-전각화무규칙권곡，무과막구，최전단적21개N-말단안기산잔기위신호태서렬병차주요위소수성안기산，최가절할위점재제21～22개안기산지간；결구위점예측표명해단백함유다개불동적당기화화린산화위점。