CAJ | 학술논문

为从分子水平上探讨西藏牦牛的序列多态性、群体遗传多样性和系统进化关系,本研究对17个西藏牦牛类群170个个体的mtDNA COⅠ全序列进行测序,用MEGA5.0、DNASP5.0等软件分析核苷酸组成、单倍型多样性和核苷酸多样性.基于Kimura-2-Parameter双参数模型,分别采用邻近法(NJ)和最大似然法(UPGMA)构建系统进化树,分析不同牦牛类群的亲缘关系和分类.结果表明:①西藏17个牦牛类群的mtDNA COⅠ全序列长度均为1 545 bp,个体间无长度差异,无内含子,起始密码子为AUG(ATG),终止密码子为UAA(TAA),共编码514个氨基酸.T、C、A和G4种碱基的平均含量分别为29.5％(29.3％～ 29.8％)、25.5％(25.2％～ 25.6％)、28.7％(28.6％～ 28.9％)和16.3％(16.2％～ 16.5％); A+T的平均含量为58.2％,存在一定的碱基偏倚性.②在17个西藏牦牛类群的170头牦牛中,共发现mtDNA COⅠ有25种单倍型,单倍型多样性值在0～0.978之间,平均单倍型多样性和核苷酸多样性值分别为0.566、0.00326,表明西藏牦牛具有较丰富的遗传多样性.③西藏牦牛mtDNA CO Ⅰ中亮氨酸平均含量最多(11.496％),半胱氨酸平均含量最少(0.1946％).碱性氨基酸、酸性氨基酸的含量分别为6.6171％、4.8627％;亲水性氨基酸、疏水性氨基酸分别为57.39％、42.61％.④基于mtDNA COⅠ,西藏17个牦牛类群可分为2大类,即类乌齐(LWQ)牦牛单独成一类,其它牦牛类群聚为一类.
위종분자수평상탐토서장모우적서렬다태성、군체유전다양성화계통진화관계,본연구대17개서장모우류군170개개체적mtDNA COⅠ전서렬진행측서,용MEGA5.0、DNASP5.0등연건분석핵감산조성、단배형다양성화핵감산다양성.기우Kimura-2-Parameter쌍삼수모형,분별채용린근법(NJ)화최대사연법(UPGMA)구건계통진화수,분석불동모우류군적친연관계화분류.결과표명:①서장17개모우류군적mtDNA COⅠ전서렬장도균위1 545 bp,개체간무장도차이,무내함자,기시밀마자위AUG(ATG),종지밀마자위UAA(TAA),공편마514개안기산.T、C、A화G4충감기적평균함량분별위29.5％(29.3％～ 29.8％)、25.5％(25.2％～ 25.6％)、28.7％(28.6％～ 28.9％)화16.3％(16.2％～ 16.5％); A+T적평균함량위58.2％,존재일정적감기편의성.②재17개서장모우류군적170두모우중,공발현mtDNA COⅠ유25충단배형,단배형다양성치재0～0.978지간,평균단배형다양성화핵감산다양성치분별위0.566、0.00326,표명서장모우구유교봉부적유전다양성.③서장모우mtDNA CO Ⅰ중량안산평균함량최다(11.496％),반광안산평균함량최소(0.1946％).감성안기산、산성안기산적함량분별위6.6171％、4.8627％;친수성안기산、소수성안기산분별위57.39％、42.61％.④기우mtDNA COⅠ,서장17개모우류군가분위2대류,즉류오제(LWQ)모우단독성일류,기타모우류군취위일류.