广东农业科学
廣東農業科學
엄동농업과학
GUANGDONG AGRICULTURAL SCIENCES
2014年
10期
135-145
,共11页
王萱%吴波%程春振%姜波%钟广炎
王萱%吳波%程春振%薑波%鐘廣炎
왕훤%오파%정춘진%강파%종엄염
甜橙%乙烯诱导酯酶%家族基因%进化
甜橙%乙烯誘導酯酶%傢族基因%進化
첨등%을희유도지매%가족기인%진화
为了解甜橙乙烯诱导酯酶基因(Citrus sinensis Ethylene-induced esterase gene,CsEIE)家族成员的进化历史与功能分化,检索比对了甜橙基因组、TAIR数据库、Phytozome数据库和NCBI EST数据库中多个物种的EIE家族基因,分析了甜橙中该基因家族的全部18个成员的基因结构、染色体分布、蛋白结构域、保守序列、基因表达、进化选择方向以及系统发生关系.结果表明,CsEIE家族成员分布在4条染色体中,通常呈串联重复排列;不同基因的外显子数目变异范围为1~5;该基因家族绝大多数成员含有3个保守基序.系统发生学分析结果显示,被子植物EIE家族基因聚为3个分支,表明EIE基因家族是在被子植物分支前就已存在的古老的多基因家族,家族成员目前的分布现状是基因不断重复和丢失的结果.系统发生树中,甜橙CsEIE1~CsEIE8属于同一分支,推测其是在柑桔与研究中其他物种分化后经多次基因重复事件产生.该分支在其他被子植物中也同样有多个经独立基因重复事件形成的旁系同源,而另外两支中发生的重复事件要少得多.表达分析结果显示,CsEIE基因家族在转录活性、表达模式上已经出现了较大的分化.所有结果表明CsEIE基因家族仍在扩张,各成员在经受不同的选择压力.
為瞭解甜橙乙烯誘導酯酶基因(Citrus sinensis Ethylene-induced esterase gene,CsEIE)傢族成員的進化歷史與功能分化,檢索比對瞭甜橙基因組、TAIR數據庫、Phytozome數據庫和NCBI EST數據庫中多箇物種的EIE傢族基因,分析瞭甜橙中該基因傢族的全部18箇成員的基因結構、染色體分佈、蛋白結構域、保守序列、基因錶達、進化選擇方嚮以及繫統髮生關繫.結果錶明,CsEIE傢族成員分佈在4條染色體中,通常呈串聯重複排列;不同基因的外顯子數目變異範圍為1~5;該基因傢族絕大多數成員含有3箇保守基序.繫統髮生學分析結果顯示,被子植物EIE傢族基因聚為3箇分支,錶明EIE基因傢族是在被子植物分支前就已存在的古老的多基因傢族,傢族成員目前的分佈現狀是基因不斷重複和丟失的結果.繫統髮生樹中,甜橙CsEIE1~CsEIE8屬于同一分支,推測其是在柑桔與研究中其他物種分化後經多次基因重複事件產生.該分支在其他被子植物中也同樣有多箇經獨立基因重複事件形成的徬繫同源,而另外兩支中髮生的重複事件要少得多.錶達分析結果顯示,CsEIE基因傢族在轉錄活性、錶達模式上已經齣現瞭較大的分化.所有結果錶明CsEIE基因傢族仍在擴張,各成員在經受不同的選擇壓力.
위료해첨등을희유도지매기인(Citrus sinensis Ethylene-induced esterase gene,CsEIE)가족성원적진화역사여공능분화,검색비대료첨등기인조、TAIR수거고、Phytozome수거고화NCBI EST수거고중다개물충적EIE가족기인,분석료첨등중해기인가족적전부18개성원적기인결구、염색체분포、단백결구역、보수서렬、기인표체、진화선택방향이급계통발생관계.결과표명,CsEIE가족성원분포재4조염색체중,통상정천련중복배렬;불동기인적외현자수목변이범위위1~5;해기인가족절대다수성원함유3개보수기서.계통발생학분석결과현시,피자식물EIE가족기인취위3개분지,표명EIE기인가족시재피자식물분지전취이존재적고로적다기인가족,가족성원목전적분포현상시기인불단중복화주실적결과.계통발생수중,첨등CsEIE1~CsEIE8속우동일분지,추측기시재감길여연구중기타물충분화후경다차기인중복사건산생.해분지재기타피자식물중야동양유다개경독립기인중복사건형성적방계동원,이령외량지중발생적중복사건요소득다.표체분석결과현시,CsEIE기인가족재전록활성、표체모식상이경출현료교대적분화.소유결과표명CsEIE기인가족잉재확장,각성원재경수불동적선택압력.