食品与生物技术学报
食品與生物技術學報
식품여생물기술학보
JOURNAL OF FOOD SCIENCE AND BIOTECHNOLOGY
2012年
8期
865-870
,共6页
基因组注释%基因预测%同源性搜索
基因組註釋%基因預測%同源性搜索
기인조주석%기인예측%동원성수색
细菌基因组中基因密度高、结构相对简单,基因预测可以达到较高的准确度.细菌基因预测的一个重要问题是难以准确判断基因起始位点,目前应用最广的基因组自动注释方法给出的结果中,占总数约1/5的基因的起始位点有分歧,尚无利用基因结构的统计特征改进起始位点预测的有效方法.通过蛋白质同源性搜索,为推断起始位点提供新的线索.对氧化葡萄糖酸杆菌Gluconobacter oxydans 621H全基因组的分析表明,这种方法可以实质性改善起始位点预测结果.
細菌基因組中基因密度高、結構相對簡單,基因預測可以達到較高的準確度.細菌基因預測的一箇重要問題是難以準確判斷基因起始位點,目前應用最廣的基因組自動註釋方法給齣的結果中,佔總數約1/5的基因的起始位點有分歧,尚無利用基因結構的統計特徵改進起始位點預測的有效方法.通過蛋白質同源性搜索,為推斷起始位點提供新的線索.對氧化葡萄糖痠桿菌Gluconobacter oxydans 621H全基因組的分析錶明,這種方法可以實質性改善起始位點預測結果.
세균기인조중기인밀도고、결구상대간단,기인예측가이체도교고적준학도.세균기인예측적일개중요문제시난이준학판단기인기시위점,목전응용최엄적기인조자동주석방법급출적결과중,점총수약1/5적기인적기시위점유분기,상무이용기인결구적통계특정개진기시위점예측적유효방법.통과단백질동원성수색,위추단기시위점제공신적선색.대양화포도당산간균Gluconobacter oxydans 621H전기인조적분석표명,저충방법가이실질성개선기시위점예측결과.
