作物学报
作物學報
작물학보
ACTA AGRONOMICA SINICA
2012年
9期
1570-1582
,共13页
郑炜君%徐兆师%冯志娟%李连城%陈明%柴守诚%马有志
鄭煒君%徐兆師%馮誌娟%李連城%陳明%柴守誠%馬有誌
정위군%서조사%풍지연%리련성%진명%시수성%마유지
NF-YB家族%全基因组鉴定%进化%差异表达%启动子
NF-YB傢族%全基因組鑒定%進化%差異錶達%啟動子
NF-YB가족%전기인조감정%진화%차이표체%계동자
利用大豆基因组数据库,通过生物信息学手段,鉴定大豆NF-YB家族基因的全序列、定位和拷贝数,通过序列比对进行进化和分类分析.利用大豆高通量RNA测序数据、NCBI中UniGene的EST表达数据进行组织表达谱分析.结果表明,大豆基因组中含有28个NF-YB家族基因,分布于大豆的14条染色体上,系统进化树分析将其分成3类.启动子分析表明,几乎全部NF-YB家族基因的启动子区均含有逆境应答反应顺式作用元件.各个发育阶段中,多数成员至少在一个组织中表达,10个差异表达的基因中有2个在根瘤中特异表达,2个在根中特异表达,2个在根瘤中优势表达,另外4个在其他部位优势表达.研究结果促进了NF-YB家族基因的功能研究与利用.
利用大豆基因組數據庫,通過生物信息學手段,鑒定大豆NF-YB傢族基因的全序列、定位和拷貝數,通過序列比對進行進化和分類分析.利用大豆高通量RNA測序數據、NCBI中UniGene的EST錶達數據進行組織錶達譜分析.結果錶明,大豆基因組中含有28箇NF-YB傢族基因,分佈于大豆的14條染色體上,繫統進化樹分析將其分成3類.啟動子分析錶明,幾乎全部NF-YB傢族基因的啟動子區均含有逆境應答反應順式作用元件.各箇髮育階段中,多數成員至少在一箇組織中錶達,10箇差異錶達的基因中有2箇在根瘤中特異錶達,2箇在根中特異錶達,2箇在根瘤中優勢錶達,另外4箇在其他部位優勢錶達.研究結果促進瞭NF-YB傢族基因的功能研究與利用.
이용대두기인조수거고,통과생물신식학수단,감정대두NF-YB가족기인적전서렬、정위화고패수,통과서렬비대진행진화화분류분석.이용대두고통량RNA측서수거、NCBI중UniGene적EST표체수거진행조직표체보분석.결과표명,대두기인조중함유28개NF-YB가족기인,분포우대두적14조염색체상,계통진화수분석장기분성3류.계동자분석표명,궤호전부NF-YB가족기인적계동자구균함유역경응답반응순식작용원건.각개발육계단중,다수성원지소재일개조직중표체,10개차이표체적기인중유2개재근류중특이표체,2개재근중특이표체,2개재근류중우세표체,령외4개재기타부위우세표체.연구결과촉진료NF-YB가족기인적공능연구여이용.
