数学的实践与认识
數學的實踐與認識
수학적실천여인식
MATHEMATICS IN PRACTICE AND THEORY
2013年
14期
114-122
,共9页
基因识别%信噪比%阈值%Bootstrap重复抽样
基因識彆%信譟比%閾值%Bootstrap重複抽樣
기인식별%신조비%역치%Bootstrap중복추양
gene identification%SNR%threshold%Bootstrap sampling with reptition
在很长的DNA序列中,DFT的大量运算会影响基因识别的效率,对此提出了在Voss映射下仅依赖于碱基在三种不同位置上出现频率的信噪比计算公式,推导发现在Voss与Z-curve映射下其频谱之间存在4倍缩放关系,仿真实验验证了此结果.针对阈值判别的主观性和经验性等缺陷,运用仿真实验方法确定不同类基因的阈值.从敏感性、特异性和精确度三方面对不同阈值下的测试结果进行了评估.同时提出了基于Bootstrap重复抽样的基因最优阈值算法,对不同类基因的最优阈值进行了预测,其中人和鼠类的最优阈值为1.930,并分析了算法的有效性和可行性,其精确度达到了92.8％.
在很長的DNA序列中,DFT的大量運算會影響基因識彆的效率,對此提齣瞭在Voss映射下僅依賴于堿基在三種不同位置上齣現頻率的信譟比計算公式,推導髮現在Voss與Z-curve映射下其頻譜之間存在4倍縮放關繫,倣真實驗驗證瞭此結果.針對閾值判彆的主觀性和經驗性等缺陷,運用倣真實驗方法確定不同類基因的閾值.從敏感性、特異性和精確度三方麵對不同閾值下的測試結果進行瞭評估.同時提齣瞭基于Bootstrap重複抽樣的基因最優閾值算法,對不同類基因的最優閾值進行瞭預測,其中人和鼠類的最優閾值為1.930,併分析瞭算法的有效性和可行性,其精確度達到瞭92.8％.
재흔장적DNA서렬중,DFT적대량운산회영향기인식별적효솔,대차제출료재Voss영사하부의뢰우감기재삼충불동위치상출현빈솔적신조비계산공식,추도발현재Voss여Z-curve영사하기빈보지간존재4배축방관계,방진실험험증료차결과.침대역치판별적주관성화경험성등결함,운용방진실험방법학정불동류기인적역치.종민감성、특이성화정학도삼방면대불동역치하적측시결과진행료평고.동시제출료기우Bootstrap중복추양적기인최우역치산법,대불동류기인적최우역치진행료예측,기중인화서류적최우역치위1.930,병분석료산법적유효성화가행성,기정학도체도료92.8％.
