食品科学
食品科學
식품과학
FOOD SCIENCE
2013年
3期
153-157
,共5页
嗜热链球菌%clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR)%检测%同源性
嗜熱鏈毬菌%clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR)%檢測%同源性
기열련구균%clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR)%검측%동원성
为探明内蒙古的8株嗜热链球菌的CRISPR,用PCR方法扩增了其CRISPR序列,并采用生物信息学方法分析和预测了重复序列(direct repeat,DR)的同源性及二级结构.结果表明:除S4只含有一个CRISPR结构外,其余7株嗜热链球菌均检测出3条CRISPR序列,远高于CRISPR database公布细菌中具有该结构的比例(46.4％),且分别具特异性的重复序列(DR1～DR3); CRISPR最长达2853bp,最短仅101bp.对DR的二级结构预测发现,DR1～DR3均能形成回文结构,但茎环大小会有差异;在同源性比对中发现,除多数同属或同种外,供试DR还与个别远缘菌种具有高同源性,这种现象证明了供试菌株的CRISPR序列同样存在的水平基因转移,并可能存在其他的进化进程.
為探明內矇古的8株嗜熱鏈毬菌的CRISPR,用PCR方法擴增瞭其CRISPR序列,併採用生物信息學方法分析和預測瞭重複序列(direct repeat,DR)的同源性及二級結構.結果錶明:除S4隻含有一箇CRISPR結構外,其餘7株嗜熱鏈毬菌均檢測齣3條CRISPR序列,遠高于CRISPR database公佈細菌中具有該結構的比例(46.4％),且分彆具特異性的重複序列(DR1～DR3); CRISPR最長達2853bp,最短僅101bp.對DR的二級結構預測髮現,DR1～DR3均能形成迴文結構,但莖環大小會有差異;在同源性比對中髮現,除多數同屬或同種外,供試DR還與箇彆遠緣菌種具有高同源性,這種現象證明瞭供試菌株的CRISPR序列同樣存在的水平基因轉移,併可能存在其他的進化進程.
위탐명내몽고적8주기열련구균적CRISPR,용PCR방법확증료기CRISPR서렬,병채용생물신식학방법분석화예측료중복서렬(direct repeat,DR)적동원성급이급결구.결과표명:제S4지함유일개CRISPR결구외,기여7주기열련구균균검측출3조CRISPR서렬,원고우CRISPR database공포세균중구유해결구적비례(46.4％),차분별구특이성적중복서렬(DR1～DR3); CRISPR최장체2853bp,최단부101bp.대DR적이급결구예측발현,DR1～DR3균능형성회문결구,단경배대소회유차이;재동원성비대중발현,제다수동속혹동충외,공시DR환여개별원연균충구유고동원성,저충현상증명료공시균주적CRISPR서렬동양존재적수평기인전이,병가능존재기타적진화진정.
