食品科学
食品科學
식품과학
FOOD SCIENCE
2013年
10期
263-267
,共5页
马月姣%孙晓红%赵勇%卢瑛%吴启华%潘迎捷
馬月姣%孫曉紅%趙勇%盧瑛%吳啟華%潘迎捷
마월교%손효홍%조용%로영%오계화%반영첩
副溶血性弧菌%tdh%肠内细菌基因组间重复序列分析%细菌基因外重复回文序列扩增%分型
副溶血性弧菌%tdh%腸內細菌基因組間重複序列分析%細菌基因外重複迴文序列擴增%分型
부용혈성호균%tdh%장내세균기인조간중복서렬분석%세균기인외중복회문서렬확증%분형
目的:采用细菌基因外重复回文序列扩增(REP-PCR)和肠道细菌基因间重复序列扩增(ERIC-PCR)两种方法对副溶血性弧菌2株标准株,13株实验室保存菌株和73株分离菌株共88株进行分子分型.方法:通过REP和ERIC-PCR指纹图谱扩增,利用NTsys-pc软件采用Dice系数对指纹图谱进行聚类结果分析.结果:所有供试菌株可通过此两种方法进行分型得到清晰的指纹图谱,并反映出副溶血性弧菌具有丰富的遗传多样性,REP-PCR扩增出5～9条分布在609～4200bp之间的条带,可将副溶血性弧菌分为5个群12类型,分辨指数达0.93,其中tdh+株在相似系数0.86时可聚类在第Ⅰ群；ERIC-PCR扩增出5～11条分布在400～7593bp之间的条带,将副溶血性弧菌分为7个群11个类型,分辨指数为0.94,其中tdh+株在相似系数0.76时可聚类在第Ⅰ群.结论:两种方法均显现出很好的分型能力,能够很好地将环境分离tdh+菌株和标准菌株聚类在一起,其中REP-PCR较ERIC-PCR重复性更好.
目的:採用細菌基因外重複迴文序列擴增(REP-PCR)和腸道細菌基因間重複序列擴增(ERIC-PCR)兩種方法對副溶血性弧菌2株標準株,13株實驗室保存菌株和73株分離菌株共88株進行分子分型.方法:通過REP和ERIC-PCR指紋圖譜擴增,利用NTsys-pc軟件採用Dice繫數對指紋圖譜進行聚類結果分析.結果:所有供試菌株可通過此兩種方法進行分型得到清晰的指紋圖譜,併反映齣副溶血性弧菌具有豐富的遺傳多樣性,REP-PCR擴增齣5～9條分佈在609～4200bp之間的條帶,可將副溶血性弧菌分為5箇群12類型,分辨指數達0.93,其中tdh+株在相似繫數0.86時可聚類在第Ⅰ群；ERIC-PCR擴增齣5～11條分佈在400～7593bp之間的條帶,將副溶血性弧菌分為7箇群11箇類型,分辨指數為0.94,其中tdh+株在相似繫數0.76時可聚類在第Ⅰ群.結論:兩種方法均顯現齣很好的分型能力,能夠很好地將環境分離tdh+菌株和標準菌株聚類在一起,其中REP-PCR較ERIC-PCR重複性更好.
목적:채용세균기인외중복회문서렬확증(REP-PCR)화장도세균기인간중복서렬확증(ERIC-PCR)량충방법대부용혈성호균2주표준주,13주실험실보존균주화73주분리균주공88주진행분자분형.방법:통과REP화ERIC-PCR지문도보확증,이용NTsys-pc연건채용Dice계수대지문도보진행취류결과분석.결과:소유공시균주가통과차량충방법진행분형득도청석적지문도보,병반영출부용혈성호균구유봉부적유전다양성,REP-PCR확증출5～9조분포재609～4200bp지간적조대,가장부용혈성호균분위5개군12류형,분변지수체0.93,기중tdh+주재상사계수0.86시가취류재제Ⅰ군；ERIC-PCR확증출5～11조분포재400～7593bp지간적조대,장부용혈성호균분위7개군11개류형,분변지수위0.94,기중tdh+주재상사계수0.76시가취류재제Ⅰ군.결론:량충방법균현현출흔호적분형능력,능구흔호지장배경분리tdh+균주화표준균주취류재일기,기중REP-PCR교ERIC-PCR중복성경호.
